慢性骨髓炎患者骨组织的转录组特征分析 |
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引用本文: | 张扬,刘亦杨,沈立锋,林炳远,寿旦,郭峭峰,张春.慢性骨髓炎患者骨组织的转录组特征分析[J].中国骨伤,2024,37(5):519-526. |
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作者姓名: | 张扬 刘亦杨 沈立锋 林炳远 寿旦 郭峭峰 张春 |
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作者单位: | 浙江中医药大学附属第一医院 浙江省中医院骨伤研究所, 浙江 杭州 310053;南京中医药大学中西医结合临床医学院 南京鼓楼医院, 江苏 南京 210008;浙江省立同德医院骨伤科, 浙江 杭州 310012;浙江大学医学院附属邵逸夫医院骨科, 浙江 杭州 310005;浙江中医药大学药学院, 浙江 杭州 310053 |
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基金项目: | 浙江省基础公益研究计划(编号:LGF19H060007,LGF20H060004;LGF21H280004;LY20H270002);浙江省中医药科技计划(编号:2021ZA033,2021ZB060) |
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摘 要: | 目的:采集和分析慢性骨髓炎患者骨组织的转录组信息,为探究慢性骨髓炎发病的分子机制,明确MAPK信号通路在慢性骨髓炎发病过程中的作用。方法:收集2019年6月至2020年6月就诊的四肢创伤性骨髓炎4例,病灶骨样本(Necrosis组)以及正常骨组织(Control组),使用Illumina HiSeq Xten高通量测序平台采集转录组信息,并采用FPKM方法计算基因在骨组织中的表达量。通过对比病灶组织与正常组织的转录本水平,筛选差异基因,并进行GO富集和KEGG富集。采用大鼠骨髓炎动物模型,选取细胞外信号调节酶MAP3K7(mitogen-activated protein 3 kinase 7)、活化T细胞核因子1(nuclear factor of activated T cells 1,NFATC1)做差异靶点的免疫组化学的验证。结果:高通量测序共获得5 548个差异基因,其中Necrosis组上调 2 701个,下调2 847个。筛选正常骨组织和病灶骨的差异基因中富集到MAPK信号通路的基因,并与破骨细胞分化(osteoclast differentiation)信号通路相关的基因取交集,共有基因为核因子κB激酶亚基β抑制剂IκBKβ(inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit beta)、MAP3K7、NFATC1、核因子κB亚基2(nuclear factor kappa B subunit 2,NFκB2)。在大鼠骨髓炎模型中,MAP3K7、NFATC1在骨髓以及损伤骨组织周围高表达。结论:基于转录组学分析显示慢性骨髓炎的发病和MAPK信号通路相关,IκBKβ、MAP3K7、NFATC1、NFκB2有可能成为新的临床诊断和疾病治疗的靶点。
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关 键 词: | 转录组学 慢性骨髓炎 MAPK信号通路 破骨细胞分化信号通路 |
收稿时间: | 2023/4/17 0:00:00 |
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