| 以c-MET为抗癌靶点的海洋小分子虚拟筛选 |
| |
| 引用本文： | 罗连响,郑晓祺,王渠,罗辉. 以c-MET为抗癌靶点的海洋小分子虚拟筛选[J]. 中国海洋药物, 2022, 41(3): 57-63 |
| |
| 作者姓名： | 罗连响 郑晓祺 王渠 罗辉 |
| |
| 作者单位： | 南方海洋科学与工程广东省实验室（湛江）,广东医科大学第一临床医学院;广东医科大学附属医院第一临床医学院,广东医科大学第一临床医学院,南方海洋科学与工程广东省实验室湛江 |
| |
| 基金项目： | 南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江)(湛江湾实验室)项目(ZJW-2019-07)资助；湛江市科技计划项目(2019A01009);广东省基础与应用基础研究(2019A1515110201)；广东医科大学学科建设项目(4SG21004G) |
| |
| 摘 要： | 目的：运用计算机虚拟筛选技术和分子动力学模拟寻找海洋小分子库(SWMD)中抗癌靶点c-MET的小分子抑制剂。方法：利用schrodinger中Ligand Docking模块对海藻代谢物数据库(SWMD)和PDB网站检索的c-MET蛋白（PDB：2rfs）进行基于受体的分子对接筛选，采用对接得分前十的结果，利用Swiss ADME网站进行成药性分析。最后将最好的结果用Gromacs进行分子动力学模拟。结果：分子对接结果显示打分前十的化合物都能与蛋白有较好的结合效果和对接姿势，蛋白与化合物之间的相互作用主要以氢键作用为主。分子动力学结果显示配体能在受体的结合口袋中稳定存在，同时具备较为稳定的对接构象。结论：基于分子对接技术和分子动力学虚拟筛选潜在的抗癌靶点c-MET的小分子抑制剂,为研发抗癌海洋药物提供科学指导与理论依据。
|
| 关 键 词： | c-MET；分子对接；分子动力学；海洋小分子；ADME筛选 |
| 收稿时间： | 2021-05-24 |
| 修稿时间： | 2021-07-07 |
Virtual screening of Marine small molecules with c-Met as an anticancer target |
| |
| Lianxiang Luo,Xiaoqi Zheng,Qu Wang and Hui Luo. Virtual screening of Marine small molecules with c-Met as an anticancer target[J]. Chinese Journal of Marine Drugs, 2022, 41(3): 57-63 |
| |
| Authors: | Lianxiang Luo Xiaoqi Zheng Qu Wang Hui Luo |
| |
| Affiliation: | Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory Zhanjiang,,,Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory Zhanjiang |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | c-Met molecular docking molecular dynamics Marine small molecules ADME screening |
|
| 点击此处可从《中国海洋药物》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中国海洋药物》下载全文 |
