使用R语言metaMA程序包实现基因表达谱数据的Meta分析

基因芯片技术原理为杂交测序,即碱基互补配对原则。基因芯片技术发展迅速,是进行基因分析的有力工具。由于基因芯片类型及其数据格式的多样性,对基因组数据进行全面和完整的分析具有重要意义。R是一个免费、开源的统计分析软件,通过加载不同包,能实现对不同类型基因芯片的分析。使用基于R语言的metaMA包前,需要把不同研究基因转化为统一格式。通过加载metaMA包,使用Meta分析筛选出差异表达的基因。基因在病例组与对照组中的表达是否有差异,不同的实验可能得出不同的结论。Meta分析可综合这些实验结果,使结论更可靠。本文以3例口腔鳞状细胞癌研究获得的基因组数据为例,介绍如何使用R语言metaMA包找出不同研究中差异表达的基因。