| 食管鳞癌中miRNA-mRNA调控网络的构建和信号通路分析 |
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| 引用本文： | 杨玲玲,杨兰,孙璐娜,戴天运,孙鹏,申嘉炜,陈珏宇,陈云昭. 食管鳞癌中miRNA-mRNA调控网络的构建和信号通路分析[J]. 重庆医科大学学报, 2020, 45(9): 1243-1249 |
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| 作者姓名： | 杨玲玲 杨兰 孙璐娜 戴天运 孙鹏 申嘉炜 陈珏宇 陈云昭 |
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| 作者单位： | 1. 石河子大学医学院病理系/一附院病理科，石河子 832000；2. 石河子大学医学院，石河子 832000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（编号：81860518、81260301）； |
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| 摘 要： | 目的:构建食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中miRNA-mRNA的调控网络,对候选基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,为ESCC发生发展的分子机制研究提供一定的理论指导。方法:从GEO数据库中筛选ESCC组织中的差异表达miRNA(differentially expressed miRNA,DE miRNA)和差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并用在线数据库预测调控DE miRNA的靶基因。对DE miRNA的靶基因及DEGs取交集得到候选基因,使用DAVID在线数据库对其进行GO富集分析和KEGG分析,并运用GEPIA网站进行生存分析。结果:筛选出4个DE miRNA(miR-34c-5p、miR-944、miR-133b、miR-139-5p),分析DE miRNA在ESCC组织和正常食管组织中的表达情况。候选...
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| 关 键 词： | 食管鳞癌 miRNA 靶基因 生物信息学 |
Construction of miRNA-mRNA regulatory network and signal pathway analysis in esophageal squamous cell carcinoma |
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| Yang Lingling,Yang Lan,Sun Lun,Dai Tianyun,Sun Peng,Shen Jiawei,Chen Jueyu,Chen Yunzhao. Construction of miRNA-mRNA regulatory network and signal pathway analysis in esophageal squamous cell carcinoma[J]. Journal of Chongqing Medical University, 2020, 45(9): 1243-1249 |
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| Authors: | Yang Lingling Yang Lan Sun Lun Dai Tianyun Sun Peng Shen Jiawei Chen Jueyu Chen Yunzhao |
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