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鼠疫耶尔森菌pgm位点及其侧翼序列遗传变异的比较分析
引用本文:童宗中,周冬生,宋亚军,张玲,韩延平,裴德翠,庞昕,李敏,崔百忠,王津,郭兆彪,祁芝珍,金丽霞,翟俊辉,杜宗敏,王效义,汪建,杨焕明,黄培堂,杨瑞馥. 鼠疫耶尔森菌pgm位点及其侧翼序列遗传变异的比较分析[J]. 解放军医学杂志, 2004, 29(4): 300-306
作者姓名:童宗中  周冬生  宋亚军  张玲  韩延平  裴德翠  庞昕  李敏  崔百忠  王津  郭兆彪  祁芝珍  金丽霞  翟俊辉  杜宗敏  王效义  汪建  杨焕明  黄培堂  杨瑞馥
作者单位:100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所;中国科学院北京基因组研究所;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所;青海省地方病预防控制研究所;中国科学院北京基因组研究所
基金项目:国家”8 63”基金 (编号 2 0 0 1AA2 2 30 61 ),国家自然科学基金 (编号30 371 2 84)资助课题
摘    要:目的研究鼠疫耶尔森菌中国自然分离株pgm位点及其侧翼序列的变异,了解不同疫源地菌株间的毒力差异,为鼠疫防治提供帮助。方法比较分析现有4株菌的pgm位点及其侧翼序列的变异,采用PCR、等位基因特异性PCR扩增260株中国自然分离株和7株假结核耶尔森菌。结果除锡林郭勒高原型和青海田鼠型菌株外,其他菌株均缺失了YPl666的70~87bp之间的18bp碱基。1406bp处T的缺失仅存在于东方型菌株中。北天山东段型及西段A、B型,锡林郭勒高原型,青海田鼠型菌株的pgm位点下游都没有IS100插入;锡林郭勒高原型和青海田鼠型菌株的色素沉着区有1个IS285插入,在其下游3kb区域还有1个IS100插入。冈底斯山型和昆仑山A、B型菌株的pgm位点上游侧翼区与其他菌株不同。36株菌的pgm位点缺失,缺失的菌株主要集中在鄂尔多斯高原型,松辽平原B型,昆仑山A、B型4种生态型菌株中。结论北天山东段型及西段A、B型,锡林郭勒高原型,青海田鼠型菌株是中国鼠疫耶尔森菌中比较古老的菌株。锡林郭勒高原型和青海田鼠型菌株是一个独特的分支,建议归为第4个生物型——田鼠型。北天山东段型及西段A、B型,锡林郭勒高原型,青海田鼠型菌株的pgm位点,由于在其下游没有IS100插入,所以稳定、不易缺失。pgm位点及其侧翼序列的变异与菌株的生物型、自然疫源地和生态型都具有一定的相关性。

关 键 词:耶尔森氏菌  鼠疫  pgm位点  遗传变异
修稿时间:2003-11-19

Comparative analysis of genetic variations of pgm locus and its flanking regions in Yersinia pestis
Tong Zongzhong,Zhou Dongsheng,Song Yajun et al. Comparative analysis of genetic variations of pgm locus and its flanking regions in Yersinia pestis[J]. Medical Journal of Chinese People's Liberation Army, 2004, 29(4): 300-306
Authors:Tong Zongzhong  Zhou Dongsheng  Song Yajun et al
Affiliation:Tong Zongzhong,Zhou Dongsheng,Song Yajun et al. Institute of Microbiology and Epidemiology,Academy of Military Medical Sciences,Beijing 100071,China
Abstract:
Keywords:Yersinia pestis  pgm locus  genetic variation
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