| 食管癌细胞系KYSE150中RNA干扰MTA1的基因芯片分析 |
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| 引用本文： | 张素洁,王海娟,刘健,张雪燕,梁萧,孟希亭,付明,林晨,胡毅,钱海利. 食管癌细胞系KYSE150中RNA干扰MTA1的基因芯片分析[J]. 癌症进展, 2012, 10(3): 211-215 |
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| 作者姓名： | 张素洁 王海娟 刘健 张雪燕 梁萧 孟希亭 付明 林晨 胡毅 钱海利 |
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| 作者单位： | 中国人民解放军总医院肿瘤内科,北京,100853;中国医学科学院,肿瘤医院肿瘤研究所,分子肿瘤学国家重点实验室,北京,100021 |
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| 基金项目： | 国家自然基金，国家重点基础研究发展计划 |
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| 摘 要： | 目的探讨MTA1对食管癌转移相关基因的影响。方法用RNA干扰的方法在食管癌细胞系KYSE150中沉默MTA1基因的表达,随后进行转移相关基因芯片分析。以两次芯片分析中均上调2倍以上(或下调1/2)为差异显著基因。通过DIVID生物信息学数据库进行gene ontology的通路分析。结果在两次基因芯片分析中均有意义上调的基因共有7个,分别是LAMC1、MMP14、MMP15、MDM2、API5、ODC1、PTGS2;而两次均显著下调的基因共有14个,它们是CSF1R、HGF、IGF2、ITGA6、MMP9、MMP11、MMP13、CASP8、CTSD、TMPRSS4、THBS2、TIMP1、ENPP2、SNCG。通过在DAVID生物信息学数据库中对上述表达差异显著的基因进行通路分析,结果提示差异基因主要富集在5条信号通路上,分别是肿瘤信号通路(MDM2、CASP8、CSF1R、HGF、ITGA6、LAMC1、MMP9、PTGS2)、ECM受体整合信号通路(LAMC1、THBS、ITGA6)、基质金属蛋白酶信号通路(TIMP1、MMP9)、小细胞肺癌信号通路(ITGA6、Cox2)和黏着斑信号通路(ITGA6、HGF、IGF2)。结论 MTA1参与了转移相关的一系列分子改变事件,尚需进一步的分子生物学方法验证这些基因调控的信号途径。
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| 关 键 词： | MTA1 肿瘤转移 食管癌 RNA干扰 基因芯片 |
Microarray analysis of human esophageal cancer cell line silenced MTA1 by siRNA |
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| Zhang Sujie , Wang Haijuan , Liu Jian , Zhang Xueyan , Liang Xiao , Meng Xiting , Fu Ming , Lin Chen , Hu Yi , Qian Haili. Microarray analysis of human esophageal cancer cell line silenced MTA1 by siRNA[J]. Oncology Progress, 2012, 10(3): 211-215 |
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| Authors: | Zhang Sujie Wang Haijuan Liu Jian Zhang Xueyan Liang Xiao Meng Xiting Fu Ming Lin Chen Hu Yi Qian Haili |
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| Affiliation: | Zhang Sujie Wang Haijuan. Liu Jian Zhang Xueyan Liang Xiao Meng Xiting Fu Ming Lin Chen Hu Yi Qian Haili 1Department of Medical Ocology, The General Hospital of Chinese People＇s Liberation Army, Beijing 100853, China 2State Key Laboratory of Molecular Oncology, Cancer Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | MTA1 metastasis esophageal cancer RNA interference microarray |
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