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SSX基因家族HLA-A2.1限制性CTL表位预测及其MHC-I亲和力分析
引用本文:何仰东 吴玉章 林治华 贾正才 姜曼 黎万玲 付晓岚 邓一静 倪兵. SSX基因家族HLA-A2.1限制性CTL表位预测及其MHC-I亲和力分析[J]. 第三军医大学学报, 2006, 28(9): 872-875
作者姓名:何仰东 吴玉章 林治华 贾正才 姜曼 黎万玲 付晓岚 邓一静 倪兵
作者单位:[1]第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所,重庆400038 [2]重庆工学院生物工程学院,重庆400050
基金项目:国家重点基础研究发展规划资助项目(“973”项目)(2003CB514108);国家自然科学基金资助项目(30571835)
摘    要:目的 通过对肿瘤基因SSX家族不同成员进行CTL表位预测,并对其与MHC-I亲和力进行分析,为探索基于SSX肿瘤基因家族的免疫治疗奠定基础。方法 利用基于超基序结合量化基序方案开发的HLA-A2.1限制性CTL表位预测软件,对SSX基因家族不同成员进行CTL表位预测,然后合成SSX相关待测表位肽P1(AMTKLGFKA)、P4(AMT-KLGFNV)、P5(AMTKLGFKV)和P6(VMTKLGFKV),再对这些合成肽与MHC-I结合亲和力及其结合物稳定性进行实验分析。结果与实验阳性肽(HBcAg,18~27)相比,除P1外,P4、P5、P6均显示较高的结合亲和力;而结合稳定性实验(DC50)结果显示,P1、P4与阳性对照肽(HBcAg,18~27)DC。均大于8h,而P5和P6的DC50介于2~4h之间。结论 计算机软件预测的CTL表位肽,经过体外亲和力与结合稳定性实验筛选到2条理想的表位肽,为该表位的下一步体内鉴定奠定基础。

关 键 词:SSX肿瘤基因 表位预测 HLA-A2.1限制性 结合亲和力
文章编号:1000-5404(2006)09-0872-04
收稿时间:2005-11-07
修稿时间:2005-11-072006-01-04

Prediction of HLA-A2.1 restricted CTL epitope of SSX gene family and affinity assay of these epitopes with MHC- I molecule
HE Yang-dong, WU Yu-zhang, LIN Zhi-hua, JIA Zheng-cai , JIANG Man , LI Wan-ling, FU Xiao-lan , DENG Yi-jing, NI Bing. Prediction of HLA-A2.1 restricted CTL epitope of SSX gene family and affinity assay of these epitopes with MHC- I molecule[J]. Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae, 2006, 28(9): 872-875
Authors:HE Yang-dong   WU Yu-zhang   LIN Zhi-hua   JIA Zheng-cai    JIANG Man    LI Wan-ling   FU Xiao-lan    DENG Yi-jing   NI Bing
Affiliation:1. Department of Immunology, College of Medicine, Third Military Medical University, Chongqing 400038; 2.Department of Bioengineering, Chongqing Institute of Technology, Chongqing 400050, China
Abstract:
Keywords:SSX tumor gene   epitope prediction   HLA-A2.1 restriction   combining affinity
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