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膀胱癌m6A调节因子预后模型建立与分析
作者姓名:白洋洋  郭依琳  陈瑞廷  潘世杰  孙继建
作者单位:1. (河南省中医院(河南中医药大学第二附属医院)泌尿外科;2. 郑州大学第二附属医院妇科肿瘤临床医学研究中心
摘    要:目的 分析m6A调节因子对膀胱癌(bladder cancer, BC)预后的影响,建立预后预测模型。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库获取397例BC组织的高通量测序数据和对应的临床病理特征数据。在26个m6A调节因子中,采用单因素Cox回归筛选预后相关的m6A调节因子,利用最小绝对值收敛和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)Cox回归分析方法构建BC预后预测模型,比较高低风险组总生存期(overall survival, OS)、免疫检查点相关基因和靶向治疗相关基因表达的差异。通过基因集富集分析比较高低风险组中信号通路的富集情况,采用单样本基因富集分析(single sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)和估计恶性肿瘤组织中基质和免疫细胞(estimation of stromal and immune cells in malignant tumors using expression data...

关 键 词:膀胱癌  m6A调节因子  免疫浸润  预后模型
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