| 东南亚禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶变异特征及进化分析 |
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| 引用本文： | 张继荣,姚青,张茜.东南亚禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶变异特征及进化分析[J].宁夏医学杂志,2009,31(4):289-290. |
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| 作者姓名： | 张继荣 姚青 张茜 |
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| 作者单位： | 宁夏医科大学,宁夏,银川,750004 |
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| 基金项目： | 国家科技部平台课题，美国NIH、USDA以及加拿大IDRC项目 |
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| 摘 要： | 目的分析东南亚H5N1禽流感病毒NA蛋白特点,比较各国病毒NA核酸进化特点,为人禽流感防控工作提供参考。方法从GenBank获得东南亚和我国H5N1禽流感病毒NA核酸序列,ClustalX1.83和MEGA4.0对NA核酸和蛋白分析,构建遗传进化树。结果2004年以后东南亚各国H5N1病毒NA茎部均有20个氨基酸残基缺失;越南、泰国和柬埔寨及印尼样本分别在NA多个位点氨基酸残基替换相同,上述国家样本在进化树中各聚一分支内;2005年中国与2006年后老挝样本聚于一分支。结论2004年以后病毒可能能更好的适应人体内环境;越南、泰国、印尼H5N1病毒NA具有地域性;2006年以后老挝毒株可能由2005年中国毒株扩散到老挝。
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| 关 键 词： | 禽流感H5N1病毒 NA特征 进化 |
Study on the characteristic of avian influenza H5N1 subtype NA in Southeast Asians |
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| ZHANG Ji-rong,YAO Qing,ZHANG Qian.Study on the characteristic of avian influenza H5N1 subtype NA in Southeast Asians[J].Ningxia Medical Journal,2009,31(4):289-290. |
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| Authors: | ZHANG Ji-rong YAO Qing ZHANG Qian |
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| Institution: | Ningxia Medical University;Yinchuan 750004;China |
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| Abstract: | Objective To provide relevant information for the control of human infecting avian influenza virus by analyzing characteristics of H5N1 avian influenza HA protein in Southeast Asia and comparing evolutionary characteristics of NA nucleotide from different countries.Methods The H5N1 avian influenza virus NA nucleotide sequences in Southeast Asia and China from GenBank were retrieved, and NA nucleotide and protein were analyzed using ClustalX1.83 and MEGA4.0 and constructed phylogenetic tree.Results All H5N1 ... |
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| Keywords: | Avian influenza H5N1 virus NA characteristic Evolution |
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