基于多组学的儿童系统性红斑狼疮与皮肌炎相关共病基因分析题录

目的基于生物学信息多组学技术对儿童系统性红斑狼疮和皮肌炎共病患者相关基因的特征进行分析。方法从GEO数据库下载儿童系统性红斑狼疮(childhood-onset systemic lupus erythematos, cSLE)与皮肌炎(juvenile dermatomyositis, JDM)相关基因芯片表达谱, 将两者的差异基因取交集后进行GO功能富集及KEGG信号通路分析, 通过Cytoscape软件构建蛋白质互作网络, 筛选hub基因;使用CIBERSORT反卷积法分析关键基因和免疫细胞浸润的相关性, 将经验证的关键基因导入Coremine Medical数据库筛选出治疗cSLE和JDM共病药物。结果差异表达基因功能主要富集于I型干扰素通路以及抗病毒反应等;网络拓扑学分析、经外部数据集验证后共筛选出5个关键基因STAT1、ISG15、MX1、OASL、DDX58, (P均<0.05)免疫浸润细胞相关性分析显示JDM和cSLE患者的M1巨噬细胞显著上调时与关键基因呈正相关, (P均<0.05)干扰素免疫调节、抗病毒制剂与JDM和cSLE共病患者的治疗存在密切关联, ...