| 用主成分分析探索基因表达模式 |
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| 引用本文： | 王成雄,饶妮妮,王玉.用主成分分析探索基因表达模式[J].生物医学工程学杂志,2007,24(4):736-741. |
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| 作者姓名： | 王成雄 饶妮妮 王玉 |
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| 作者单位： | 电子科技大学,生命科学与技术学院,成都,610054 |
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| 摘 要： | 以时间点(阵列)为变量,对酵母时间表达序列进行主成分分析,提取出三个主成分:第一主成分代表整个酵母细胞周期中平稳的基因表达状态,第二主成分代表酵母细胞周期中lateG1期和M期差异的基因表达状态,第三主成分表示的是earlyG1期和S/G2期差异的基因表达状态。由第二、和第三主成分揭示出基因表达谱中四个周期性基因表达模式:分别对应lateG1期、M期、earlyG1期和S/G2期,而且发现了一批表达水平呈周期性变化的基因,为进一步研究基因周期性表达和基因调控网络提供有价值的指导。
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| 关 键 词： | 主成分分析 微阵列 基因表达谱 基因表达模式 |
| 修稿时间： | 2005-05-192005-11-18 |
Principal Component Analysis for Exploring Gene Expression Patterns |
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| Wang Chengxiong,Rao Nini,Wang Yu.Principal Component Analysis for Exploring Gene Expression Patterns[J].Journal of Biomedical Engineering,2007,24(4):736-741. |
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| Authors: | Wang Chengxiong Rao Nini Wang Yu |
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| Institution: | College of Life Science and Technology, UEST of China, Chengdu 610054 ,China |
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| Abstract: | When projecting microarray data of yeast time series into principal component space based on time-points(arrays), we can not only ascribe biologically meaningful explanations to the first few principal components, but also discover sensible gene expression patterns and the according genes with periodic fluctuation; this helps the subsequent research of gene periodic expression and gene regulatory network. |
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| Keywords: | Principal component analysis Microarray Gene expression profile Gene expression pattern |
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