| 河南省首起奥密克戎COVID-19疫情全基因组特征与溯源分析题录 |
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| 引用本文： | 宋云,卢世栋,胡晓,朱琳,张白帆,潘静静,李东晓,卫海燕,李懿,赵升,王海峰,叶莹,黄学勇,马红霞.河南省首起奥密克戎COVID-19疫情全基因组特征与溯源分析题录[J].中华微生物学和免疫学杂志,2023(4). |
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| 作者姓名： | 宋云 卢世栋 胡晓 朱琳 张白帆 潘静静 李东晓 卫海燕 李懿 赵升 王海峰 叶莹 黄学勇 马红霞 |
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| 作者单位： | 1. 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所;3. 河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所 |
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| 摘 要： | 目的对河南省首起本土奥密克戎COVID-19确诊病例的呼吸道标本进行SARS-CoV-2全基因组测序, 分析基因组突变及分子溯源情况。方法采用全基因组测序技术对2022年1月7日—1月29日疫情相关的COVID-19病例阳性样本进行全基因组测序和序列比对分析, 分析病毒全基因组序列的一致性和变异进化情况。结果通过SARS-CoV-2基因组高通量测序, 共获得120例病例的SARS-CoV-2全基因组序列, 占安阳COVID-19疫情总病例数的25.64%(120/468)。与武汉参考株(NC045512.2)相比, 120例病例的全基因组序列存在57～59个核苷酸突变位点, 在共享57个核苷酸位点的基础上增加1～2个核苷酸突变位点, 均属于VOC/Omicron变异株(BA.1.1进化分支), 基因组序列高度同源。其中, 首发病例A全基因组序列含有57个核苷酸突变位点, 首发病例B全基因组序列在含有57个相同的核苷酸突变位点基础上, 增加1个特有变异位点(C1594T), 提示二者为同一传播链。经中国疾病预防控制中心和河南省疾病预防控制中心与国内本土病例和输入病例...
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| 关 键 词： | SARS-CoV-2 奥密克戎变异株 基因组特征 |
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