| 辽宁省汉城型汉坦病毒基因亚型分析 |
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| 引用本文： | 耿英芝, 田疆, 刘芸, 王博, 孙英伟, 李鑫, 姚文清. 辽宁省汉城型汉坦病毒基因亚型分析[J]. 中国公共卫生, 2012, 28(12): 1594-1596. DOI: 10.11847/zgggws-2012-28-12-15 |
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| 作者姓名： | 耿英芝 田疆 刘芸 王博 孙英伟 李鑫 姚文清 |
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| 作者单位： | 1.辽宁省疾病预防控制中心感传所, 沈阳110005 |
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| 基金项目： | 国家科技重大专项(项目编号：2009ZX10004-209) |
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| 摘 要： | 目的 分析辽宁省汉城型汉坦病毒(HV)的基因亚型及其分布情况。方法 收集辽宁省内主要肾综合征出血热(HFRS)流行地区的鼠肺和病人血清标本,采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原,应用HV特异性引物以RT-PCR方法扩增标本中M和S基因片段的特异性核苷酸序列,测序后与已知病毒序列进行比较分析,构建系统发生树,以明确其型别和亚型及其地理分布情况。结果 辽宁省HFRS疫区褐家鼠携带的病毒均为汉城型病毒(SEOV);对鼠肺及病人携带HV的部分M片段及部分S片段进行核苷酸序列分析表明,发现SEOV的同源性较高,变异较小,稳定性较高,而且地理位置相近地区基因组核苷酸序列的同源性很高(>98.8%),具有小范围的地理聚集现象。结论 辽宁省流行的SEOV均为S3亚型,基因亚型分布比较单一。
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| 关 键 词： | 汉坦病毒(HV) 汉城型病毒(SEOV) 基因亚型 系统发生分析 分布 |
| 收稿时间： | 2012-02-08 |
Genetic subtypes and distribution of Seoul hanta virus in Liaoning province |
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| GENG Ying-zhi, TIAN Jiang, LIU Yun, . Genetic subtypes and distribution of Seoul hanta virus in Liaoning province[J]. Chinese Journal of Public Health, 2012, 28(12): 1594-1596. DOI: 10.11847/zgggws-2012-28-12-15 |
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| Authors: | GENG Ying-zhi TIAN Jiang LIU Yun |
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| Affiliation: | 1.Department of Endemic Disease Control, Liaoning Provicial Center for Disease Control and Prevention, Shenyang, Liaoning Province 110005, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | hantavirus Seoul hanta virus genetic subtype phylogenetic analysis distribution |
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