| 农村寄宿制学校宋内志贺菌菌痢暴发及全基因组溯源分析 |
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| 引用本文： | 刘东立,张义,马国柱,曹磊,石一,李文涓,刘长宏,史伟,王舒,张铮,宁少奇,孙亮,关蓉晖,张同军,刘峰.农村寄宿制学校宋内志贺菌菌痢暴发及全基因组溯源分析[J].中国学校卫生,2018,39(5):741-746. |
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| 作者姓名： | 刘东立 张义 马国柱 曹磊 石一 李文涓 刘长宏 史伟 王舒 张铮 宁少奇 孙亮 关蓉晖 张同军 刘峰 |
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| 作者单位： | 陕西省疾病预防控制中心病原微生物所,西安,710054 |
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| 摘 要： | 对陕西省3起寄宿制学校感染性腹泻暴发事件进行流行病学调查、病原分离鉴定及分子溯源分析,为科学指导临床诊断治疗及流行病学调查工作提供参考.方法 对陕西省3起寄宿制学校感染性腹泻事件开展现场调查,描述疫情三间分布,分析流行特征.采集病例肛拭子标本、剩余食物、环境及水源标本,进行病原分离鉴定.选择代表菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型,全基因组多位点序列分型(MLST),单核苷酸多态(SNP)分析,预测毒力基因谱及耐药基因谱.结果 2017年8-9月报告的3起疫情共发病282例,以发热、腹泻为主,里急后重及粘液脓血便症状不明显,均为学生群体,性别间差异无统计学意义.病例肛拭宋内志贺菌检出率为62.22% (56/90),肛拭ipaH基因检测阳性率为69.70% (46/66),环境样本阳性率为12.31% (8/65);PFGE,全基因组MLST,SNP分析表明,3起疫情代表菌株不同源.毒力基因预测共有12种毒力基因.耐药基因预测有氨基糖苷类、甲氧苄啶类、磺胺类、β-内酰胺类、四环素类、大环内酯类的耐药基因.结论 陕西省3起寄宿制学校宋内志贺菌引起的细菌性痢疾暴发之间无直接关联,病原菌毒力基因谱与国内常见宋内志贺菌特征一致,存在多重耐药基因.
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| 关 键 词： | 农村人口 志贺菌 宋氏 痢疾 疾病暴发流行 基因组 细菌 流行病学 学生 |
Epidemiological tracing of Shigella Sonnei bacillary dysentery outbreaks in rural boarding schools by whole-genome sequencing |
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