| 应用生物信息学分析确定PLK4是乳腺癌的关键预后基因 |
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| 引用本文： | 徐佳玮,陈雨秋,王文艺,顾军. 应用生物信息学分析确定PLK4是乳腺癌的关键预后基因[J]. 实用临床医药杂志, 2021, 25(23): 69-76,81. DOI: 10.7619/jcmp.20213104 |
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| 作者姓名： | 徐佳玮 陈雨秋 王文艺 顾军 |
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| 作者单位： | 南京医科大学金陵临床医学院中国人民解放军普通外科研究所,江苏南京,210000;南京大学医学院附属金陵医院中国人民解放军普通外科研究所,江苏南京,210000;中国人民解放军东部战区总医院中国人民解放军普通外科研究所,江苏南京,210000 |
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| 摘 要： | 目的 应用生物信息学分析探讨Polo样激酶4(PLK4)在乳腺癌中的生物学作用、预后价值和对局部免疫微环境的影响.方法 通过Oncomine数据库挖掘PLK4在多种肿瘤中的表达水平;使用GEPIA数据库及HPA数据库检索PLK4在乳腺癌组织与正常组织中的表达差异;分别通过UALCAN数据库及TIMER数据库分析PLK4表达水平与乳腺癌患者临床特点及免疫浸润的相关性;采用K-M Plotter数据库评估PLK4在乳腺癌中的预后价值.应用Coexpedia数据库构建PLK4在乳腺癌中的共表达基因网络,并通过DAVID数据库对PLK4及其关键基因进行功能分析.结果 乳腺癌组织中,PLK4 mRNA和蛋白表达较正常乳腺组织均上调,特别是在P53突变和三阴性乳腺癌中差异更为显著(P＜0.05),且预示着更差的预后.PLK4在乳腺癌免疫微环境中与免疫细胞的表达呈正相关.筛选出PLK4的25个关键基因,即TPX2、CCNB2、CCNB1、BIRC5、CDC20和FOXM1等基因,其生物学功能主要与细胞分裂、细胞周期、细胞增殖和泛素化修饰等相关.KEGG通路富集分析表明,PLK4与P53信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路和PI3 K-Akt信号通路等相关.结论 PLK4在乳腺癌组织中呈高表达可提示患者不良预后,其影响乳腺癌局部免疫微环境,在一定程度上表现为癌基因的特性,推测其可作为乳腺癌治疗疗效的预测指标,有望成为乳腺癌临床诊疗的新靶点.
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| 关 键 词： | 乳腺癌 Polo样激酶4 生物信息学 肿瘤 基因调控 |
Identification of PLK4 as a key prognostic gene in breast cancer by bioinformatics analysis |
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| XU Jiawei,CHEN Yuqiu,WANG Wenyi,GU Jun. Identification of PLK4 as a key prognostic gene in breast cancer by bioinformatics analysis[J]. Journal of Clinical Medicine in Practice, 2021, 25(23): 69-76,81. DOI: 10.7619/jcmp.20213104 |
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| Authors: | XU Jiawei CHEN Yuqiu WANG Wenyi GU Jun |
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