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三叶木通MSAP反应体系的优化及引物筛选
引用本文:高 寰,张 铮,周 婷,曹向然,陈阳洋,王喆之.三叶木通MSAP反应体系的优化及引物筛选[J].医学教育探索,2012,43(3):572-576.
作者姓名:高 寰  张 铮  周 婷  曹向然  陈阳洋  王喆之
作者单位:1.陕西师范大学生命科学学院,陕西 西安 710062 2.陕西师范大学 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室,陕西 西安 710062 3.西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西 西安 710062
基金项目:陕西省科技攻关项目(2010K17-05-02);2010年国家级大学生创新性实验计划资助项目(101071825)
摘    要:目的 研究三叶木通表观遗传多样性,建立并优化三叶木通甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)反应体系。方法 以三叶木通叶片为材料,利用正交试验建立三叶木通MSAP的预扩增和选择性扩增的最佳反应体系。结果 建立的MSAP最佳反应体系为酶切反应:HpaII/MspI 10 U,EcoR I 10 U;预扩增反应:总体积20 μL,连接产物2 μL,E00、HM00各125 ng,dNTPs 0.312 5 mmol/L,Mg2+ 1.875 mmol/L,Taq DNA聚合酶2 U;选择性扩增反应:总体积20 μL,稀释200倍的预扩增产物5 μL,引物E-ACT、HM-CAT各50 ng,dNTPs 0.250 mmol/L,Mg2+ 1.250 mmol/L,Taq DNA酶1 U。利用优化的体系,最终从MSAP的80对引物中筛选出有效引物6对。结论 建立的MSAP反应体系可用于后续三叶木通DNA甲基化的相关研究。

关 键 词:三叶木通  MSAP  遗传多样性  体系优化  引物筛选  酶切反应

Optimization of MSAP reaction system for Akebia trifoliata and primers screening
GAO Huan,ZHANG Zheng,ZHOU Ting,CAO Xiang-ran,CHEN Yang-yang,WANG Zhe-zhi.Optimization of MSAP reaction system for Akebia trifoliata and primers screening [J].Researches in Medical Education,2012,43(3):572-576.
Authors:GAO Huan  ZHANG Zheng  ZHOU Ting  CAO Xiang-ran  CHEN Yang-yang  WANG Zhe-zhi
Abstract:
Keywords:Akebia trifoliata (Thunb  ) Koidz    MSAP  genctic diversity  optimization of system  primers screening  enzyme digestion
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