| 不同产地忽地笑的叶绿体基因psb A-trn H序列分析 |
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| 引用本文： | 全妙华,赵丽娟,贺安娜,佘朝文,向小亮,蒋向辉. 不同产地忽地笑的叶绿体基因psb A-trn H序列分析[J]. 中草药, 2019, 50(2): 491-501 |
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| 作者姓名： | 全妙华 赵丽娟 贺安娜 佘朝文 向小亮 蒋向辉 |
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| 作者单位： | 怀化学院生物与食品工程学院, 湖南 怀化 418008;怀化学院 民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室, 湖南怀化 418008;湘西药用植物与民族植物学湖南省高校重点实验室, 湖南 怀化 418008,怀化学院生物与食品工程学院, 湖南 怀化 418008;怀化学院 民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室, 湖南怀化 418008,怀化学院 民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室, 湖南怀化 418008;湘西药用植物与民族植物学湖南省高校重点实验室, 湖南 怀化 418008,怀化学院生物与食品工程学院, 湖南 怀化 418008;怀化学院 民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室, 湖南怀化 418008;湘西药用植物与民族植物学湖南省高校重点实验室, 湖南 怀化 418008,怀化学院生物与食品工程学院, 湖南 怀化 418008,怀化学院 民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室, 湖南怀化 418008;湘西药用植物与民族植物学湖南省高校重点实验室, 湖南 怀化 418008 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31470403）；湖南省双一流学科建设经费资助 |
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| 摘 要： | 目的通过叶绿体基因psb A-trn H序列分析,探讨我国忽地笑种质资源的系统进化关系及分子鉴定方法。方法分别提取15省(市)52个忽地笑居群的DNA,经PCR扩增叶绿体基因psb A-trn H序列及测序,并用Mega5.0等软件对测序结果进行分析。结果 52条psb A-trn H序列长度为544～656 bp,GC含量为35.8%～37.0%,遗传距离为0.000 00～0.009 47;核苷酸变异(多态性)位点数共33个,其中简约信息位点9个,单一突变位点18个,插入/缺失片段6个;单倍型数量(H)10个,单倍型多态性水平(Hd)0.749,核苷酸多态性(π)0.002 63,收集的忽地笑资源具有较高的遗传多样性。最大简约法(maximum parsimony,MP)系统树中52个居群聚为4类,并且该聚类结果与其地理分布基本一致。结论不同产地忽地笑居群的遗传变异较大,psb A-trn H序列可作为忽地笑种源分子鉴定的依据;我国忽地笑种质资源在进化上具有明显的地域性特征。
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| 关 键 词： | 忽地笑 居群 psbA-trnH序列 核苷酸多态性 系统聚类 |
| 收稿时间： | 2018-07-09 |
Sequence analysis of psbA-trnH gene in chloroplast of Lycoris aurea populations from different regions |
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| QUAN Miao-hu,ZHAO Li-juan,HE An-n,SHE Chao-wen,XIANG Xiao-liang and JIANG Xiang-hui. Sequence analysis of psbA-trnH gene in chloroplast of Lycoris aurea populations from different regions[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2019, 50(2): 491-501 |
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| Authors: | QUAN Miao-hu ZHAO Li-juan HE An-n SHE Chao-wen XIANG Xiao-liang JIANG Xiang-hui |
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| Affiliation: | College of Biological and Food Engineering, Huaihua University, Huaihua 418008, China;Key Laboratory of Hunan Province for Study and Utilization of Ethnic Medicinal Plant Resources, Huaihua University, Huaihua 418008, China;Key Laboratory of Hunan Higher Education for Hunan Xiangxi medicinal Plant and Ethnobotany, Huaihua University, Huaihua 418008, China,College of Biological and Food Engineering, Huaihua University, Huaihua 418008, China;Key Laboratory of Hunan Province for Study and Utilization of Ethnic Medicinal Plant Resources, Huaihua University, Huaihua 418008, China,Key Laboratory of Hunan Province for Study and Utilization of Ethnic Medicinal Plant Resources, Huaihua University, Huaihua 418008, China;Key Laboratory of Hunan Higher Education for Hunan Xiangxi medicinal Plant and Ethnobotany, Huaihua University, Huaihua 418008, China,College of Biological and Food Engineering, Huaihua University, Huaihua 418008, China;Key Laboratory of Hunan Province for Study and Utilization of Ethnic Medicinal Plant Resources, Huaihua University, Huaihua 418008, China;Key Laboratory of Hunan Higher Education for Hunan Xiangxi medicinal Plant and Ethnobotany, Huaihua University, Huaihua 418008, China,College of Biological and Food Engineering, Huaihua University, Huaihua 418008, China and Key Laboratory of Hunan Province for Study and Utilization of Ethnic Medicinal Plant Resources, Huaihua University, Huaihua 418008, China;Key Laboratory of Hunan Higher Education for Hunan Xiangxi medicinal Plant and Ethnobotany, Huaihua University, Huaihua 418008, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lycoris aurea(L''Her.) Herb. population psbA-trnH sequence nucleotide h diversity ierarchical cluster |
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