严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中微小RNA表达谱数据的靶基因分析 |
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引用本文: | 张海军,郝岱峰,柴家科,郁永辉.严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中微小RNA表达谱数据的靶基因分析[J].中华损伤与修复杂志,2016,11(2):120-121. |
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作者姓名: | 张海军 郝岱峰 柴家科 郁永辉 |
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作者单位: | 1. 100048 北京,解放军总医院第一附属医院全军烧伤研究所,烧伤整形科,创口修复中心 |
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基金项目: | 全军后勤科技重点专项(BWS14J48,BWS14J49) |
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摘 要: | 目的初步确定严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中差异表达微小RNA(miRNA)的靶基因,从而为进一步机制研究指明方向。
方法采用高通量芯片技术检测严重烫伤大鼠早期胫骨前肌miRNA表达谱数据,筛选部分差异明显且相关性较好的miNRA,包括miR-1-3p、miR-206-3p、miR-133a-3p、miR-22-3p、miR-30a-5p、miR-30d-3p、miR-190b-5p、miR-628和miR-678,利用互联网络检索数据库Mirbase、Miranda和Mirdb,对这些差异miRNA进行靶基因预测。
结果3大数据库预测结果显示差异miRNA主要调控79个靶基因,网络关系图显示了miR-1-3p、miR-206-3p、miR-133a-3p、miR-22-3p、miR-30a-5p、miR-30d-3p、miR-190b-5p、miR-628和miR-678等miRNA及其预测靶基因之间复杂的调控网络关系。
结论根据初步的预测结果,miR-1-3p和miR-206-3p共同调控的靶基因较多,可作为进一步机制研究的理论依据。
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关 键 词: | 预测 烧伤 肌,骨骼 靶基因 |
收稿时间: | 2016-01-09 |
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