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基于miRNA-mRNA 网络筛查并验证胃癌诊断和预后评估相关的标志 物及其潜在分子机制
引用本文:李昶蓥,郭志云.基于miRNA-mRNA 网络筛查并验证胃癌诊断和预后评估相关的标志 物及其潜在分子机制[J].中国肿瘤生物治疗杂志,2022,29(12):1094-1100.
作者姓名:李昶蓥  郭志云
作者单位:西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都 610031
基金项目:四川省科技厅自然科学基金资助项目(No. 2022NSFSC0779);中央高校基本科研业务费基础培育项目(No. 2682021ZTPY016)
摘    要:目的:通过生物信息学方法探索并实验验证胃癌相关标志物miR-1-3p对胃癌细胞增殖的作用及其分子机制。方法:收 集TCGA 数据库中胃癌(n=375)及癌旁组织(n=45)的转录组数据,构建胃癌特异性mRNA-miRNA 网络,筛选潜在的miRNA 类标 志物,利用TargetScan 预测标志物的下游靶基因且分析它们的功能。选取人正常胃上皮细胞GES-1 及胃癌细胞AGS、MKN45、NCI-N87,用qPCR 法检测细胞中miR-1-3p 和心肌蛋白(MYOCD)的表达,用lipofectamine 2000 将miR-1-3p 模拟物转染至胃癌细 胞中,CCK-8 法测定轨染后细胞的增殖能力,WB 法测定MYOCD 的表达量,双荧光素酶报告基因实验验证miR-1-3p 与MYOCD 之间的靶向结合关系。结果:通过数据库数据分析得到差异表达的259 个miRNA 和7 545 个mRNA,构建胃癌特异性mRNA-miRNA 调节网络,分析网络中脆弱结构后确定miR-1-3p 为潜在的胃癌标志物,ROC 曲线和Kaplan-Meier 分析显示其对胃癌的诊 断和预后评估有重要意义。细胞实验显示miR-1-3p 在胃癌细胞中呈低表达(P<0.05),过表达miR-1-3p 可抑制胃癌细胞AGS 和 MKN-45 的增殖能力(P<0.05 或P<0.01),且可抑制MYOCD的表达(P<0.01)。TargetScan数据库预测到MYOCD 的3''UTR 区域中有 两个与miR-1-3p 结合的位点,双荧光素酶报告基因实验证实miR-1-3p 与MYOCD 靶向结合且负调控MYOCD 的表达(P<0.01)。结论: miR-1-3p 可能是胃癌诊断和预后相关潜在的标志物,且miR-1-3p 可能是通过靶向MYOCD 来影响胃癌细胞的增殖。

关 键 词:胃癌  miR-1-3p  心肌蛋白  诊断  预后  生物标志物
收稿时间:2022/6/26 0:00:00
修稿时间:2022/12/15 0:00:00

Screening and validation of markers related to diagnosis and prognosis assessment of gastric cancer based on miRNA-mRNA network and their potential molecular mechanisms
LI Changying,GUO Zhiyun.Screening and validation of markers related to diagnosis and prognosis assessment of gastric cancer based on miRNA-mRNA network and their potential molecular mechanisms[J].Chinese Journal of Cancer Biotherapy,2022,29(12):1094-1100.
Authors:LI Changying  GUO Zhiyun
Institution:School of Life Science and Engineering,Southwest Jiaotong University, Chengdu 610000, Sichuan, China
Abstract:
Keywords:gastric cancer  myocardin (MYOCD)  miR-1-3p  diagnosis  prognosis  biomarker
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