DHRS4反义RNA结合蛋白的高通量检测与分析 |
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引用本文: | 苏中静,宋旭红,常晓兰,黄东阳.DHRS4反义RNA结合蛋白的高通量检测与分析[J].解剖学研究,2018(1). |
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作者姓名: | 苏中静 宋旭红 常晓兰 黄东阳 |
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作者单位: | 汕头大学医学院组织学与胚胎学教研室;汕头大学医学院细胞生物学教研室 |
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摘 要: | 目的 DHRS4是细胞内NADP(H)依赖性视黄醇脱氢/还原酶家族成员4的编码基因。与人类DHRS4基因以头对头形式存在的反义转录本AS1DHRS4,可以调控DHRS4基因的转录。本研究高通量检测分析DHRS4反义RNA结合的蛋白以探讨DHRS4反义转录本调控正义基因表达的作用机制。方法采用甲醛交联细胞内的核酸-蛋白复合物,然后通过生物素标记的奇数组和偶数组寡核苷酸作为探针pull-down AS1DHRS4结合的蛋白,LCMS/MS鉴定后数据库比对分析DHRS4反义RNA结合的蛋白。结果奇数组和偶数组探针pull-down后分别鉴定得到650种和508种蛋白,两组探针检测的共同蛋白434种。大部分蛋白为结合蛋白并与RNA的加工和修饰相关。结论 DHRS4反义RNA结合的蛋白的检测和分析为今后进一步研究反义RNA功能和机制提供了线索和基础。
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关 键 词: | DHRS4 反义RNA RNA结合蛋白 寡核苷酸探针 |
High-throughput detection and analysis of DHRS4 antisense RNA binding proteins |
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