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DHRS4反义RNA结合蛋白的高通量检测与分析
引用本文:苏中静,宋旭红,常晓兰,黄东阳.DHRS4反义RNA结合蛋白的高通量检测与分析[J].解剖学研究,2018(1).
作者姓名:苏中静  宋旭红  常晓兰  黄东阳
作者单位:汕头大学医学院组织学与胚胎学教研室;汕头大学医学院细胞生物学教研室
摘    要:目的 DHRS4是细胞内NADP(H)依赖性视黄醇脱氢/还原酶家族成员4的编码基因。与人类DHRS4基因以头对头形式存在的反义转录本AS1DHRS4,可以调控DHRS4基因的转录。本研究高通量检测分析DHRS4反义RNA结合的蛋白以探讨DHRS4反义转录本调控正义基因表达的作用机制。方法采用甲醛交联细胞内的核酸-蛋白复合物,然后通过生物素标记的奇数组和偶数组寡核苷酸作为探针pull-down AS1DHRS4结合的蛋白,LCMS/MS鉴定后数据库比对分析DHRS4反义RNA结合的蛋白。结果奇数组和偶数组探针pull-down后分别鉴定得到650种和508种蛋白,两组探针检测的共同蛋白434种。大部分蛋白为结合蛋白并与RNA的加工和修饰相关。结论 DHRS4反义RNA结合的蛋白的检测和分析为今后进一步研究反义RNA功能和机制提供了线索和基础。

关 键 词:DHRS4  反义RNA  RNA结合蛋白  寡核苷酸探针

High-throughput detection and analysis of DHRS4 antisense RNA binding proteins
Abstract:
Keywords:
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