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siRNA对SGC7901/VCR细胞mdr1基因沉默效果的影响因素分析
引用本文:高福莲,朱晓燕,王峰,吴景兰,张钦宪. siRNA对SGC7901/VCR细胞mdr1基因沉默效果的影响因素分析[J]. 肿瘤防治研究, 2006, 33(3): 151-155. DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.446
作者姓名:高福莲  朱晓燕  王峰  吴景兰  张钦宪
作者单位:郑州大学基础医学院组胚教研室; 郑州大学基础医学院组胚教研室 河南省分子医学重点学科开放实验室; 新乡医学院;
摘    要:目的分析siRNA沉默人胃癌SGC7901/VCR细胞mdr1基因效果的相关因素。方法设计并体外转录合成4条靶向mdr1的siRNA(mdr1si326、mdr1si1513、mdr1si2631和mdr1si3071),转染SGC7901/VCR细胞,用RTPCR和免疫印迹检测mdr1mRNA和Pgp的表达、流式细胞仪检测细胞内阿霉素的蓄积和MTT法检测细胞对阿霉素的敏感性,综合这4方面结果评价4条siRNA的沉默效果情况;用分子生物学软分析siRNA沉默效果的影响因素。结果沉默效果最好的mdr1si326和较好的mdr1si2631靶序列编码Pgp的跨膜区而且自身无茎和袢;沉默效果较差的mdr1si3071和最差的mdr1si1513靶序列编码Pgp的胞内区,前者自身成茎和成袢。沉默效果最好的mdr1si326和较好的mdr1si2631靶序列在靶位点和靶位点外间有较少的碱基配对和氢键。siRNA的沉默效果与siRNA3’5’端3个碱基中的A/U数量、N1和N19、GC含量间无规律可循。结论siRNA沉默SGC7901/VCR细胞mdr1的效果与靶序列的结构关系密切。

关 键 词:小分子干扰RNA  mdr1基因  SGC7901/VCR细胞  基因沉默效果  siRNA设计  
文章编号:1000-8578(2006)03-0151-05
收稿时间:2005-06-20
修稿时间:2005-06-202005-09-29

Analysis of Influence Factors on siRNA Efficacy Silencing mdr1 Gene in SGC7901/VCR Cells
GAO Fu-lian,ZHU Xiao-yan,WANG Feng,WU Jing-lan,ZHANG Qin-xian. Analysis of Influence Factors on siRNA Efficacy Silencing mdr1 Gene in SGC7901/VCR Cells[J]. Cancer Research on Prevention and Treatment, 2006, 33(3): 151-155. DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.446
Authors:GAO Fu-lian  ZHU Xiao-yan  WANG Feng  WU Jing-lan  ZHANG Qin-xian
Affiliation:1. Department of Histology and Embryology; School of Basical Medical Sciences; Zhengzhou University; He’nan Key Laboratory of Molecular Medicine; Zhengzhou 450052; China; 2. Xinxiang Medical College;
Abstract:
Keywords:siRNA   mdrl genes SGC7901/VCR cells    Gene silencing efficacy   siRNA design
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