DNA提取方法对桑树内生菌多样性研究的影响

【目的】基于聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）对桑树根、茎、叶组织内生菌多样性的分析，结合浓度、纯度、 PCR扩增性等指标，比较4种DNA提取方法之优劣。【方法】采用常见的DNA提取方法十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）法、缓冲液振荡（SPBS）法、液氮研磨（LNG）法和试剂盒（KIT）法提取桑树各组织DNA,从PCR-DGGE多样性等多方面对4种方法进行比较。【结果】对于桑树根和茎， DNA提取浓度最高的方法是LNG法，最低的是SPBS法；桑树叶情况则完全相反。桑树各组织， KIT法获得的DNA纯度均最高。桑树各组织通过16S rDNA PCR-DGGE比较内生细菌多样性，适宜的DNA提取方法是LNG法或CTAB法，不宜采用KIT法提取DNA。内生真菌ITS PCR-DGGE分析结果完全不同，最佳提取方法是KIT法，最不适宜的DNA提取方法因组织不同而异。【结论】对于桑树内生菌研究，最佳的DNA提取方法因组织不同而异，还与研究的内生菌种类有关系。

Comparison of Total DNA Extraction Methods for Studying Endophyte Diversity in Mulberry