实时RT-PCR基因表达相对定量REST(C)软件分析与2(-△△CT)法比较 |
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引用本文: | 庾蕾,刘建平,庄志雄,杨淋清,张仁利,叶小明,程锦泉.实时RT-PCR基因表达相对定量REST(C)软件分析与2(-△△CT)法比较[J].热带医学杂志,2007,7(10):956-958. |
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作者姓名: | 庾蕾 刘建平 庄志雄 杨淋清 张仁利 叶小明 程锦泉 |
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作者单位: | [1]深圳市疾病预防控制中心分子生物学研究室,深圳518020 [2]华中科技大学同济医学院公共卫生学院,武汉430030 |
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基金项目: | 深圳市科技计划项目(No.TH200505300499A). |
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摘 要: | 目的利用实时RT-PCR技术建立一种简便、准确的基因表达相对定量方法。方法以正常的人支气管上皮细胞株(16HBE)eDNA为模板5倍系列稀释,分别作DNA聚合酶K(POLK)和磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)基因标准曲线。以不同剂量反式二羟环氧笨并芘(anti-BPDE)诱导的16HBE、anti—BPDE转化的16HBE及肺癌细胞株(H1299)cDNA为模板,进行实时定量RT—PCR。以GAPDH基因作为内参照,进行POLK基因表达相对定量。实验数据分别采用2^(-△△CT)法及REST软件分析。结果5倍系列稀释法制作的标准曲线,呈现较好的线型关系(Rsq 0.997)。POLK及GAPDH基因扩增效率分别为117.5%和103.5%。采用2^(-△△CT)法计算出的表达比值均比REST软件分析高。结论实时RT-PCR技术结合REST软件分析是一种简便、准确的基因表达相对定量分析手段。
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关 键 词: | 实时RT—PCR 相对定量 标准曲线 基因表达 |
文章编号: | 1672-3619(2007)10-0956-03 |
修稿时间: | 2007-05-23 |
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