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江苏七地市汉族人群常见HLA单倍型多态性分析
作者姓名:潘芹芹  马骁  樊甦  王晓艳  尤雅洁  沈捷
作者单位:南京医科大学第一附属医院HLA实验检测中心,江苏 南京 210029
基金项目:中华骨髓库课题(CMDP201909)
摘    要:目的:统计分析来自中华骨髓库江苏分库七地市汉族造血干细胞志愿者常见人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)单倍型频率,了解江苏七地市汉族人群HLA单倍型分布特点。方法:采用聚合酶链反应-直接测序分型(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)技术,对中华骨髓库江苏分库共计11 889例无血缘关系志愿者的HLAA/B/DR B1/C/DQB1位点进行高分辨分型,按地市应用Arlequin 3.5软件分别计算单倍型HLA-A-B-C、DRB1-DQB1、A-B-DRB1、A-B-DRB1-C-DQB1的频率,统计分析各地市常见HLA单倍型,并与国内已发表汉族人群数据进行比较,基于等位基因频率,采用Hierarchical Clustering算法应用SPSS软件进行聚类分析。结果:HLA-A-B-C单倍型中,A*30∶01-B*13∶02-C*06∶02、A*33:03-B*58∶01-C*03∶02为江苏七地市频率最高的前2位单倍型。聚类分析发现,南京、扬州、常州、镇江聚为一类,宿迁、淮...

关 键 词:人类白细胞抗原  单倍型频率  聚类分析  江苏七地市
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