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宫颈高级别神经内分泌癌的差异基因表达及免疫浸润景观
作者姓名:康佳文  向小青  蒋静雯  郭思慧  张勇  李乐赛
作者单位:1. 湖南师范大学医学院;2. 湖南省肿瘤医院
基金项目:湖南省自然科学基金(grant.2022JJ30415);
摘    要:目的 :探索宫颈高级别神经内分泌癌(HGNECC)基因表达特点和免疫浸润状态。方法 :通过整合GTEx、TCGA、GEO数据库关于HGNECC的测序数据,寻找正常样本和肿瘤样本间的差异基因(DEGs),运用GO和KEGG分析探索差异基因相关通路的富集情况。在IMMPORT网站找出免疫相关基因(IRGs)和DEGs通过VENN图求得免疫相关差异基因,应用蛋白互作网络(PPI)及cytoscape软件中MCODE及cytohubba插件找出核心基因(Hubs),运用CIBERSORT算法进行正常宫颈组织与HGENCC之间的免疫浸润的差异分析,并用ssGSEA算法来评估HGNECC肿瘤内部微环境的免疫浸润情况,比较不同的免疫检查点对在不同免疫活性患者内部的表达情况,并在DGIdb网站预测相应药物-靶点相互作用网络期望探索HGNECC具有潜在疗效的小分子靶向药物。最后免疫组化验证CXCL8在宫颈癌组织中的表达。结果 :通过差异分析,获得了HGNECC中CXCL8、IL1B、CSF2、CCL4、IL10、CCL3、CCL3L3、PTPN11、CBL、SOS1等十个Hub基因;在通过CIBERSO...

关 键 词:宫颈神经内分泌癌  免疫景观  生物信息学  差异基因
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