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用RACE技术对一株肠道病毒3''端进行扩增和序列分析
引用本文:侯俊,沈宏辉,胡燕,朱雷,王志杰,雷厉,貌盼勇. 用RACE技术对一株肠道病毒3''端进行扩增和序列分析[J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2006, 20(4): 410-412
作者姓名:侯俊  沈宏辉  胡燕  朱雷  王志杰  雷厉  貌盼勇
作者单位:100039,北京,解放军第三○二医院传染病研究所病毒研究室
摘    要:目的 应用3′RACE技术对一株本室分离肠道病毒基因组3′末端进行扩增,并对其核苷酸序列进行比较分析。方法 提取病毒总RNA,以锚定oligdT(17)引物进行逆转录,用特异引物及锚定引物进行3′RACE扩增,将PCR产物进行克隆、测序和序列分析。结果 获得了该病毒的3′端核苷酸序列,同源性分析结果显示该肠道病毒的核苷酸序列与肠道病毒76、89、90、91型的同源性最高为90%左右,而与其他型别的肠道病毒的同源性均小于80%;推导的氨基酸同源性与肠道病毒76、89、90、91型均在90%以上。结论 用RACE技术对肠道病毒3′端进行扩增及序列分析,证明该病毒属新型肠道病毒类,为进一步研究该病毒的分子生物学特性奠定了基础。

关 键 词:肠道病毒属 DNA 序列分析
收稿时间:2006-09-06
修稿时间:2006-09-06

Amplification and sequencing analysis of a strain of enterovirus by 3'''' RACE
HOU Jun,SHENG Hong-hui,HU Yan,ZHU Lei,WANG Zhi-jie,LEI Li,MAO Pan-yong. Amplification and sequencing analysis of a strain of enterovirus by 3'''' RACE[J]. Chinese journal of experimental and clinical virology, 2006, 20(4): 410-412
Authors:HOU Jun  SHENG Hong-hui  HU Yan  ZHU Lei  WANG Zhi-jie  LEI Li  MAO Pan-yong
Affiliation:Dpartment of Virology , lnstitute oflnfectioas Diseases, No .302 Hospital, Beijing 100039, China
Abstract:
Keywords:Enterovirus    DNA    Sequence analysis
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