云南省2021年手足口病病例8株埃可病毒18型分离株基因特征 |
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引用本文: | 刘艳艳,杨善蕊,段忠文,姜黎黎,伏晓庆,张勇.云南省2021年手足口病病例8株埃可病毒18型分离株基因特征[J].中国计划免疫,2022(5):503-508. |
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作者姓名: | 刘艳艳 杨善蕊 段忠文 姜黎黎 伏晓庆 张勇 |
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作者单位: | 1. 昆明市疾病预防控制中心;2. 德宏州疾病预防控制中心;3. 云南省疾病预防控制中心 |
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摘 要: | 目的 分析云南省2021年手足口病(Hand, foot, and mouth disease, HFMD)病例埃可病毒18型(Echovirus 18,E18)分离株基因特征。方法 从2021年云南省2个市州HFMD病例粪便标本中分离E18;对VP1区基因进行扩增、测序和拼接,获得全序列;构建E18分离株与GenBank中参考株的系统进化树,分析基因特征。结果 从HFMD病例中获得8株E18分离株,其完整VP1区序列的核苷酸、氨基酸同源性分别为96.75%-99.77%、97.21%-100%;与原型株Metcalf相比的核苷酸、氨基酸同源性分别为77.24%-78.63%、91.99%-93.73%。基于VP1区分型,8株分离株均属于基因型5分支2,且在VP1区存在特有的氨基酸位点变异(T80A、I240V、T274S和H281R)。结论 本研究E18分离株属于基因型5,可能在环境中循环了一段时间。需进一步加强HFMD病例E18监测和分子生物学特征研究。
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关 键 词: | 手足口病 埃可病毒18型 基因特征 |
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