多囊卵巢综合征相关miRNA调控网络的构建及生物信息学分析 |
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作者姓名: | 王棵 王丹 邱娜 郑倩文 |
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作者单位: | 电子科技大学医学院附属绵阳医院/绵阳市中心医院妇产科 |
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摘 要: | 目的 利用生物信息学方法对多囊卵巢综合征(PCOS)患者卵巢颗粒细胞差异表达的miRNA靶基因进行分析,通过构建miRNA-mRNA调控网络,为PCOS潜在发病机制研究提供新思路。方法 选择PCOS患者卵巢颗粒细胞miRNA表达数据集GES84376作为分析对象,并利用Limma分析差异表达miRNA。利用在线分析网站对差异表达的miRNA靶基因进行预测。应用DAVID网站进行生物信息学分析,并利用SRTING网站及Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络。结果 共筛选出251个miRNAs,其中3个miRNA显著上调(miR-3188、miR-4433及miR-3135b)。富集通路(KEGG)分析显示,miR-3188、miR-4433及miR-3135b的靶基因在mTOR信号通路、MAPK信号通路及PI3K/Akt信号通路中富集程度最高。通过STRING网站进行蛋白互作分析,其互作程度最高的前10位关键基因分别为:MAPK1、MDM2、FRS2、AGT、IGF1R、HDAC1、AGO1、AKT3、MTOR及CREB1。通过构建miRNA-mRNA调控网络图,结果显示...
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关 键 词: | 生物信息学分析 多囊卵巢综合征 miRNA 靶基因 |
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