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贵州省2019-2021年人源和猪源戊型肝炎病毒基因特征
引用本文:雷明玉,勾云,吴萍,黄焦,蒋维佳,余春,吴军,尹文娇,黄艳,毕胜利.贵州省2019-2021年人源和猪源戊型肝炎病毒基因特征[J].中国计划免疫,2022(5):496-502.
作者姓名:雷明玉  勾云  吴萍  黄焦  蒋维佳  余春  吴军  尹文娇  黄艳  毕胜利
作者单位:1. 贵州省疾病预防控制中心;2. 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室;3. 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
基金项目:国家科技重大专项(2018ZX10201002-009-009);
摘    要:目的 分析贵州省部分地区人源和猪源戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)流行株基因特征。方法 2019-2021年在贵州省医疗机构收集急性HEV感染者(抗-HEV IgM阳性)血清标本,在屠宰场收集猪胆汁和血清标本,提取HEV核酸,对HEV ORF2区基因进行扩增和测序,构建系统进化树,分析基因型、基因亚型及其核苷酸和氨基酸同源性。结果 从450例急性HEV感染者标本和196份猪标本中共获得53条人源和2条猪源HEV序列。人源序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为81.39%-100%和95.92%-100%,猪源序列分别为87.40%和100%;人源和猪源HEV均与HEV基因4型参考株的核苷酸同源性最高,分别为89.93%和89.83%。55条HEV序列位于系统进化树的3个分支,其中24条与4b亚型、20条与4a亚型、11条与4d亚型参考株处于同一分支,且核苷酸同源性最高,分别为95.54%、93.10%、95.72%。2条人源序列各发生1个位点的氨基酸替换。结论 2019-2021年贵州省部分地区人群和猪群中HEV优势流行株为基因4型,包括4b、4a和4d亚型,氨基酸...

关 键 词:戊型病毒性肝炎  戊型肝炎病毒  基因型  基因特征  人群  猪群
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