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丹苘软胶囊干预大鼠非酒精性脂肪肝细胞模型基因芯片的组学分析
引用本文:刘锐,刘秀芳,何嘉,李劲平,张玲,伍娟娟. 丹苘软胶囊干预大鼠非酒精性脂肪肝细胞模型基因芯片的组学分析[J]. 中华中医药学刊, 2019, 0(5): 1046-1050,I0002-I0004
作者姓名:刘锐  刘秀芳  何嘉  李劲平  张玲  伍娟娟
作者单位:1.广西中医药大学附属瑞康医院老年病科;2.广西中医药大学研究生院;3.中南大学湘雅药学院
基金项目:国家自然科学基金地区科学基金项目(81460717);广西自然科学基金面上项目(2014GXNSFAA118249)
摘    要:目的:通过筛选mRNA(ClariomTM S Assay)芯片及miRNA芯片的显著差异性基因,预测microRNA相关靶基因,探究丹苘软胶囊改善肝细胞脂肪代谢的调控机制。方法:提取丹苘软胶囊灌胃SD大鼠的含药血清,并对BRL大鼠肝细胞取对数生长期细胞进行实验,以阴性对照血清做对照,提取细胞总RNAs,采用Clariom S表达谱芯片及microRNA芯片检测细胞mRNA及miRNA的表达水平。运用生物信息学方法预测miRNA的靶基因,对脂肪代谢相关基因进行富集分析和通路分析。结果:经筛选和预测得到5629个预测靶基因参与20种生物学过程,7种细胞成分,有20种分子作用,神经营养素信号通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信号通路被富集;rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p为调控网络中心;IPA数据库共检出31个与实验有关的脂肪代谢基因。结论:丹苘软胶囊在治疗非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的机制可能与rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p,神经营养素信号通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信号通路相关性较高。

关 键 词:丹苘软胶囊  非酒精性脂肪肝  mRNA  miRNA  靶基因  生物信息学分析

Gene Chipset Analysis in Rats with Non-alcoholic Fatty Liver Disease Intervened by Danqing Soft Capsule
LIU Rui,LIU Xiufang,HE Jia,LI Jinping,ZHANG Ling,WU Juanjuan. Gene Chipset Analysis in Rats with Non-alcoholic Fatty Liver Disease Intervened by Danqing Soft Capsule[J]. Chinese Archives of Traditional Chinese Medicine, 2019, 0(5): 1046-1050,I0002-I0004
Authors:LIU Rui  LIU Xiufang  HE Jia  LI Jinping  ZHANG Ling  WU Juanjuan
Affiliation:(Ruikuang Hospital Affiliated to Guangxi University of TCM , Nanning 530011 ,Guangxi ,China;Postgraduate School of Guangxi University of TCM , Nanning 530011 ,Guangxi,China;Xiangya School of Pharmaceutical Sciences,Central South University,Changsha 410013 ,Hunan,China)
Abstract:LIU Rui;LIU Xiufang;HE Jia;LI Jinping;ZHANG Ling;WU Juanjuan(Ruikuang Hospital Affiliated to Guangxi University of TCM , Nanning 530011 ,Guangxi ,China;Postgraduate School of Guangxi University of TCM , Nanning 530011 ,Guangxi,China;Xiangya School of Pharmaceutical Sciences,Central South University,Changsha 410013 ,Hunan,China)
Keywords:Danqing Soft Capsule  non-alcoholic fatty liver disease  miRNA  target gens  bioinformatics
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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