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基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒全基因组多重PCR测序方法的建立与评价题录
引用本文:王笑阳,裴书君,陈泽倩,索文帅,易志杰,李懿,黄学勇,郭万申.基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒全基因组多重PCR测序方法的建立与评价题录[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(12).
作者姓名:王笑阳  裴书君  陈泽倩  索文帅  易志杰  李懿  黄学勇  郭万申
作者单位:1. 郑州大学公共卫生学院流行病学教研室;2. 新乡医学院公共卫生学院流行病学教研室;3. 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所
摘    要:目的基于二代测序(next generation sequencing, NGS)技术建立一种发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)基因组的测序方法。方法提取SFTSV阳性血清样本病毒核酸, 利用Primer5.0软件设计SFTSV特异性引物, 构建多重PCR方法对病毒核苷酸序列进行特异性扩增, 利用二代测序仪进行全基因组测序。结果 28份SFTSV阳性血清样本均能进行特异性扩增并获得全序, 覆盖度均超过94%, A型病毒株最多(20株)、其次为B型(4株)、E型(3株)。结论本研究基于多重PCR建立了针对SFTSV的特异性强、质量好的高通量测序方法, 提高了测序效率。

关 键 词:发热伴血小板减少综合征病毒  多重PCR  高通量测序  基因组
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