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药物靶蛋白结构域的特性研究
引用本文:王晨曲,李冬果,李霞. 药物靶蛋白结构域的特性研究[J]. 中国优生与遗传杂志, 2010, 0(4): 17-20,10
作者姓名:王晨曲  李冬果  李霞
作者单位:首都医科大学生物医学工程学院;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院;
基金项目:国家自然基金(批准号:30871394、30370798、30571034); 国家863项目(批准号:2007AA02Z329); 黑龙江科技攻关(批准号:ZJG0501、1055HG009、GB03C602-4、BMFH060044)
摘    要:目的结构域是蛋白质的结构单位和功能单位,研究药物靶蛋白结构域的特性对预测新的药物靶蛋白具有重要的意义。方法利用蛋白质互作、蛋白质结构域及药物靶蛋白数据,通过统计学检验分析药物靶蛋白与非药物靶蛋白二者结构域是否存在差异。结果药物靶蛋白含有结构域的数量与非药物靶蛋白含有结构域的数量存在显著差异(P=1.03×10-6),且药物倾向于靶向含有两个结构域的蛋白质。此外,药物靶蛋白结构域多以α螺旋为主或以α螺旋和β折叠混合的结构为主。结论研究结果表明药物靶蛋白与非药物靶蛋白二者含有结构域的个数存在显著差异,此结论为预测新的药物靶蛋白提供理论基础。

关 键 词:药物靶蛋白  结构域  蛋白质互作

Quantitative analysis on the domain of drug-target proteins
Wang Chen-qu,Li Dong-guo,Li Xia ,.. Quantitative analysis on the domain of drug-target proteins[J]. Chinese Journal of Birth Health & Heredity, 2010, 0(4): 17-20,10
Authors:Wang Chen-qu  Li Dong-guo  Li Xia   .
Affiliation:Wang Chen-qu1,Li Dong-guo1,Li Xia 1,2.(1.Biomedical Engineering College of Capital Medical University,Beijing 100069,2.College of Bioinformatics Science , Technology,Harbin Medical University,Harbin 150081)
Abstract:Objective:Domain is considered an evolutionary unit of proteins.The aim of our research is to quantitative analysis on the domains within the drug-target proteins that could useful to predicting novel drug-targets.Methods:Based on the information about protein-protein interactions,protein domains and drug-targets,we analyzed that whether the characteristic of domains within the drug-targets or within the non-drug-targets is different.Results:There is significantly different in the number of domains that wit...
Keywords:Drug targets  domain  protein-protein interaction  
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