| 铁皮石斛2个F家族ABC转运蛋白基因的克隆和表达研究 |
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| 引用本文： | 李依民,雷根平,颜永刚,彭亮,张娜,刘亮亮,黑小斌,李欢,张岗,郭顺星.铁皮石斛2个F家族ABC转运蛋白基因的克隆和表达研究[J].中草药,2017,48(15):3153-3159. |
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| 作者姓名： | 李依民 雷根平 颜永刚 彭亮 张娜 刘亮亮 黑小斌 李欢 张岗 郭顺星 |
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| 作者单位： | 陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学附属医院第一临床医学院, 陕西 咸阳 712000;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31101608）；陕西省自然科学基金项目（2017JM8030）；陕西省青年科技新星项目（2012KJXX-44） |
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| 摘 要： | 目的克隆铁皮石斛Dendrobium officinale ABC(ATP-binding cassette)转运蛋白F家族基因并进行生物信息学分析。方法利用RACE从铁皮石斛叶片cDNA中分离ABC基因,并进行编码蛋白相对分子质量、等电点、结构域、信号肽、跨膜域及亚细胞定位等生物信息学分析;采用DNASTAR和MEGA6进行氨基酸多序列比对和分子进化分析;借助实时荧光定量PCR技术检测基因组织表达模式。结果从铁皮石斛中分离到2个F家族ABC转运蛋白基因DoABCF1和DoABCF2(Gen Bank注册号KU160474和KU160475),全长为2 104 bp和2 193 bp,各编码1条由600和659个氨基酸组成的肽链,相对分子质量67 030和74 140,等电点6.20和5.71;DoABCF1和DoABCF2蛋白均包含2个保守的ABC结构域(分别为74~314、385~600和65~323、392~607)和多个基元;2个蛋白不含信号肽或跨膜域,预测均定位在叶绿体。2个基因与植物F家族ABC转运蛋白基因相似性高达80%以上,与玉米和水稻等单子叶植物F家族ABC转运蛋白基因亲缘关系较近。DoABCF1和DoABCF2基因转录本在石斛3个器官中差异表达且均在叶中高度表达,茎和根中相对表达量差异不显著;以茎为校正样本,前者在根中相对表达量为茎中的1.74倍,后者在叶中表达量为茎中的3.44倍。结论成功获得DoABCF1和DoABCF2基因全长cDNA,二者在铁皮石斛叶中的高表达特征暗示其可能在铁皮石斛生长发育过程中起一定作用。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 ATP-binding cassette 转运蛋白 克隆 表达模式 |
| 收稿时间： | 2017/1/30 0:00:00 |
Molecular cloning and expression analysis of two genes encoding F family ATP-binding cassette transporters in Dendrobium officinale |
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| LI Yi-min,LEI Gen-ping,YAN Yong-gang,PENG Liang,ZHANG N,LIU Liang-liang,HEI Xiao-bin,LI Huan,ZHANG Gang and GUO Shun-xing.Molecular cloning and expression analysis of two genes encoding F family ATP-binding cassette transporters in Dendrobium officinale[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2017,48(15):3153-3159. |
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| Authors: | LI Yi-min LEI Gen-ping YAN Yong-gang PENG Liang ZHANG N LIU Liang-liang HEI Xiao-bin LI Huan ZHANG Gang and GUO Shun-xing |
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| Institution: | College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;1st Clinical Medical College and Affiliated Hospital of Shaanxi University of Chinese Medicine, Xianyang 712000, China;College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale Kimura et Migo ATP-binding cassette protein clone expression pattern |
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