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免疫检查点相关基因预测结肠癌患者预后及其免疫状态
作者姓名:梁骏  魏学标  侯晓东  廖小龙  温剑艺  郭伟新  李汉彪  王首红
作者单位:1. 老年重症医学科,广东省老年医学研究所,南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院);2. 广东省干部健康管理中心,南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)
摘    要:目的 免疫检查点基因是调控结肠癌患者免疫应答的关键机制,并对结肠癌患者的预后、治疗具有潜在的临床应用价值,然而目前尚无基于免疫检查点基因的预后模型来预测结肠癌患者的预后和免疫状态。方法 从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和高通量基因表达(Gene Expression Omnibus,GEO)公共数据库获取并整理结肠癌患者的基因表达谱数据及其对应的临床信息,鉴定差异表达的免疫检查点基因。采用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回归分析构建免疫检查点基因相关的TCGA结肠癌患者预后模型。应用GEO结肠癌患者队列(GSE143985)进行验证。KaplanMeier曲线和受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线用于评估模型预测准确性。Spearman相关性分析观察预后模型与免疫细胞浸润情况。单因素和多因素回归分析免疫检查点风险基因及临床指标,并基于多因素回归结果构建临床列线图。结果 在正常和结...

关 键 词:免疫检查点  结肠癌  预后  免疫  列线图
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