KRAS突变对人肺腺癌转录组影响的生物信息学分析

目的 鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌是临床常见肺癌亚型，发病机制不清，预后不良。推测可能与KRAS突变对整个基因组的影响有关。本研究通过对KRAS突变型肺腺癌的转录组分析，探讨其预后不良和耐药的组学机制。为研究KRAS突变型肺腺癌的发病机制和临床治疗提供指导。方法 从公共基因表达数据库（gene expression omnibus，GEO）中下载KRAS突变型肺腺癌的转录组数据库，首先利用R语言Impute程序包进行数据标准化，然后利用Limma程序包筛选差异基因，最后利用Robust rank aggregation算法筛选显著性基因。为进一步研究其表观调控机制，我们利用R语言Clusterprofile程序包和STRING数据库分别进行了KEGG pathway分析和蛋白质互作网络分析。结果 KRAS突变对全转录组影响复杂，包括改变细胞周期促进肿瘤细胞异常增殖；影响白细胞介素-17信号通路促炎反应导致免疫耐受，促进肿瘤生长；影响细胞色素P450信号通路导致耐药。结论 KRAS突变能够引起整个基因组发生异常变化，并与促进肿瘤生长、抑制抗肿瘤免疫以及耐药相关基因的表达密切相关。