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| 江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统分析 | |
| 引用本文： | 周成林,杨启生,殷竹君,苏兆亮.江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统分析[J].新医学,2012,43(4):253-255. |
| 作者姓名： | 周成林 杨启生 殷竹君 苏兆亮 |
| 作者单位： | 1. 江苏镇江出入境检验检疫局,212001;江苏大学免疫学与免疫学检验系,212013 2. 江苏出入境检验检疫局,210001 3. 江苏大学免疫学与免疫学检验系,212013 |
| 基金项目： | 江苏出入境检验检疫局资助项目,江苏镇江市国际合作交流项目,江苏大学高级人才启动项目 |
| 摘 要： | 目的:了解江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统.方法:收集42份血清抗-HIV阳性者的血浆标本并提取RNA,逆转录为模版DNA后采用巢式 PCR法扩增env及 pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,比对确定基因亚型,分析不同途径感染者的基因亚型,构建系统进化树.结果:42份标本中,扩增出env及pol基因片段27份(64%);共发现5种 HIV-1亚型,其中 CRF01-AE亚型 19份、C亚型 2份、B亚型3份、CRF08-BC 2份、G亚型1份.经静脉药瘾感染者基因型多为CRF01-AE亚型;经性接触感染者HIV-1基因亚型包括检出的全部亚型,经性接触及吸毒感染者基因亚型均为CRF01-AE亚型.两基因构建系统进化树高度一致,主要有CRF-01AE、B-07、G、C和CRF-08BC 5种HIV亚型在流行,而以CRF-01AE为主要流行株.结论:江苏省 HIV-1基因亚型至少有5种,其中 CRF01-AE为主要亚型. |
| 关 键 词： | 人类免疫缺陷病毒 基因亚型 序列分析 进化树 |
Phylogenetic analysis and subtypes of pol and env gene in HIV-1 patients in Jiangsu Province |
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| ZHOU Cheng-lin , YANG Qi-sheng , YIN Zhu-jun , SU Zhao-liang.Phylogenetic analysis and subtypes of pol and env gene in HIV-1 patients in Jiangsu Province[J].New Chinese Medicine,2012,43(4):253-255. | |
| Authors: | ZHOU Cheng-lin YANG Qi-sheng YIN Zhu-jun SU Zhao-liang |
| Institution: | 1 Zhenjiang Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau,Jiangsu 212001,China;2 School of Medical Science and Laboratoy Medicine,Jiangsu University,Zhenjiang 212013,China;3 Jiangsu Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau,Jiangsu 210001,China; |
| Abstract: | |
| Keywords: | HIV Gene subtype Sequence analysis Phylogenetic tree |
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