大鼠背根神经节持续压迫后miRNA差异表达谱的分析及功能研究

摘要 目的：对大鼠背根神经节（dorsal root ganglion， DRG）持续压迫后所致神经病理性疼痛（neuropathic pain， NP）模型的DRG组织进行miRNA测序，应用生物信息学技术分析差异表达的miRNA及其靶基因在疾病中的定位与功能。 方法：采用随机分组法将大鼠分为2组，每组12只，分别为假手术组、CCD背根神经节持续压迫（chronic compression of the dorsal root ganglion， CCD）模型组，术后进行行为学检测。确定痛觉敏感的天数后重复造模，取材后进行miRNA转录组测序。利用生物信息学手段筛选具有显著性差异的miRNA，预测相关靶基因并对其GO功能及KEGG富集情况进行分析，使用在线数据库对miRNA与靶基因之间的属性关系建立miRNA-靶基因的调控网络。最后，通过qPCR验证差异最为显著的4条miRNA在CCD模型DRG组织中的表达情况。 结果：CCD造模7天后，大鼠痛觉最为敏感。重复造模，在第7天取材并进行miRNA转录组测序。将差异表达的miRNA以|log2（fold change）|>1且P<0.05为阈值，筛选符合要求的miRNA，与假手术组相比，有57种miRNA在CCD模型组表达上调，有17种miRNA在CCD模型组表达下调。差异表达的miRNA对应的靶基因主要富集在外泌体、细胞质、细胞膜、线粒体、内质网等结构，在细胞固有免疫、炎症信号传导、氧化应激等生物学过程中发挥重要作用，在PI3K-AKT、MAPK、JAK-STAT、钙信号等通路上均存在富集。经实验验证，miR-21-3p、miR-675-5p、miR-487b-5p、miR-3585-3p的表达与测序结果一致。 结论：在大鼠背根神经节慢性压迫所致NP模型的DRG组织中，异常表达的miRNA及其富集的相关信号通路可为NP诊断和治疗的新靶点提供新的思路。

Differential expression profile and functional study of miRNA after chronic dorsal root ganglion compression in rats