人衰变加速因子的二级结构与B细胞表位预测 |
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引用本文: | 邹强,谢佩蓉,李华,郭波,郑萍.人衰变加速因子的二级结构与B细胞表位预测[J].中国免疫学杂志,2001,17(7):388-392. |
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作者姓名: | 邹强 谢佩蓉 李华 郭波 郑萍 |
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作者单位: | 第三军医大学免疫学教研室全军免疫学研究所, |
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基金项目: | 国家自然科学基金(批准号
30080032)及重庆市科委攻关计划资助 |
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摘 要: | 目的分析预测人衰变加速因子的二级结构特征及B细胞表位。方法比较Chou&Fasman经典方案和基于多重序列比较的PHDsec二级结构预测方案的预测准确率,应用较优方案对DAF的二级结构进行预测分析;运用Hopp&Woods的亲水性方案及PHDacc可及性方案预测DAF的亲水性和可及性,结合DAF的二级结构特征,分析预测DAF的B细胞表位。结果PHDsec方案对SCR的预测准确率明显高于Chou&Fasman方案,DAF的SCR1-4中无α螺旋,仅包含β折叠及袢;推测最可能的抗原表位位于Pro73-Val79、Arg130-Leu139及Glu156-Cys163;SCR1、SCR2与SCR3、SCR4在亲水性及二级结构分布方面具有较大差异。结论研究的分析预测结果将有助于确定DAF的B细胞表位及其生物学活性部位。
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关 键 词: | 衰变加速因子 二级结构 表位 预测 B细胞 |
文章编号: | 1000-484X(2001)07-0388-05 |
Prediction of the secondary structure and B cell epitope of human
decay-accelerating factor |
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Abstract: | |
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Keywords: | Decay accelerating factor Secondary structure Epitope Prediction |
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