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小鼠动静脉内瘘增生狭窄的差异基因测序比对分析题录
作者姓名:张艾莎  隋晓露  张燕子  许云鹏  谢婷妃  袁树珍  曾启城  邹杰锋  陈继红
作者单位:深圳大学第二附属医院肾内科
摘    要:目的构建小鼠颈内动静脉内瘘(arteriovenous fistula, AVF)模型, 筛选AVF内膜增生狭窄过程中的差异表达基因, 分析研究参与AVF内膜增生狭窄的异常表达信号通路及作用机制。方法选取雄性C57BL/6小鼠46只, 按简单随机法分为AVF组和假手术组, 每组23只。AVF组行小鼠颈内AVF成形术, 假手术组分离右侧颈外静脉、颈总动脉后缝合切口。应用转录组学可逆链终止物和合成测序法测定AVF内膜增生狭窄小鼠全基因组序列, 建立微阵列数据集;应用基因芯片数据分析多重假设检验校正(Benjamini & Hochberg法)筛选AVF增生狭窄过程中的差异表达基因;利用R语言富集分析筛选AVF内膜增生狭窄过程中的差异表达基因, 并对差异表达基因及信号通路进行基因本体(gene ontology, GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析;应用多样性增量分析BUSCA软件进行AVF增生狭窄差异表达基因亚细胞定位;应用STRING数据库及Cytoscape软件进行差异表达基...

关 键 词:动静脉瘘  血管内膜  缩窄, 病理性  富集分析  差异基因表达
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