| 结核分枝杆菌PPE家族蛋白CD4+T细胞泛宿主表位的计算机预测及其γ干扰素释放实验研究 |
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| 作者姓名： | 肖婧 焦伟伟 孙琳 申晨 李洁琼 綦辉 徐放 郭雅洁 申阿东 |
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| 作者单位： | 首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045;首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所呼吸感染疾病研究室,国家临床医学中心,儿科学国家重点学科,教育部儿科重大疾病研究重点实验室,儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室,北京100045 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81200064) |
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| 摘 要： | 目的 利用计算机预测结核分枝杆菌PPE家族蛋白MHC-Ⅱ类分子限制性CD4+T细胞泛宿主表位,并利用γ干扰素释放实验进行体外验证.方法 利用网上数据库提取PPE家族全部蛋白序列.使用生物信息学软件包括SignalP4.1,SecretomeP 2.0,DAS和NetMHCII2.2等分析工具预测、筛选出MHC-Ⅱ类分子限制性CD4+T细胞泛宿主表位.最后利用γ干扰素释放实验进行合成肽段的体外实验验证其刺激激活CD4+T细胞的能力.结果 发现了34个泛宿主表位多肽,其中21个来自于PPE8蛋白,其余来自于PPE12、PPE21和PPE62蛋白.γ干扰素释放实验并未发现预测出的泛宿主表位多肽可刺激大量的CD4+T淋巴细胞产生IFN-γ的分泌,但来自于PPE8蛋白的两个泛宿主表位多肽可刺激少量的CD4+T淋巴细胞产生反应.结论 这些计算机预测出来的泛宿主表位多肽,尤其是来自PPE8蛋白的泛宿主表位多肽,可能是下一步亚单位疫苗或诊断性标志物的重要候选抗原.但仍需进一步扩大样本量进行验证.
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| 关 键 词： | 泛宿主表位 预测 MHC Ⅱ类分子 PPE家族蛋白 结核分枝杆菌 γ干扰素 |
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