转录组测序分析高尔基体蛋白73参与调控肝癌的作用机制 |
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作者单位: | 广州医科大学附属第二医院检验科,广州510260;广州医科大学附属第五医院检验科,广州510700 |
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基金项目: | 广东省医学科学技术研究项目;广州市卫生;计划生育科技项目 |
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摘 要: | 目的基于转录组分析技术,探索高尔基体蛋白73(GP73)参与调控肝癌的作用机制。方法将肝癌细胞株Hep3B分为4组:GP73干扰组和对照组、GP73过表达组和对照组,采用转录组测序技术检测4组样本mRNA的表达。根据测序数据筛选差异表达基因,通过GO功能分析和KEGG富集分析差异表达基因。Western Blot实验验证信号通路相关蛋白的表达。符合正态分布的计量资料2组间比较采用t检验。结果通过分析Hep3B细胞干扰和过表达GP73后的差异表达基因,GO分析结果揭示了586个生物过程,GP73主要参与了细胞过程、单个组织的过程、生物调节等功能。KEGG分析表明GP73主要参与了PI3K-AKT、细胞因子/细胞因子受体相互作用、TNF、JAK-STAT等与肝癌密切相关的信号通路。Western Blot验证PI3K-AKT信号通路中的3个蛋白PI3K、p-AKT和AKT,干扰组和过表达组的蛋白PI3K、p-AKT和对照组比较均有显著差异(P值均0.05)。结论通过转录组测序和生物信息分析筛选到GP73主要参与调控肝癌的信号通路,为阐明GP73对肝癌的作用机制提供了新的思路。
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关 键 词: | 肝肿瘤 转录组 信号传导 |
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