摘 要: | 目的:通过生物信息学方法识别六价铬[Cr (Ⅵ)]致肝脏损伤的相关基因,为探讨Cr (Ⅵ)致机体肝脏损伤作用机制的研究提供新的方向。方法:检索基因表达综合(GEO)数据库中与“[Cr (Ⅵ)]liver”相关数据集,下载数据集GSE65198,通过limma包筛选差异表达基因(DEGs),并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用String数据库进行蛋白-蛋白互作(PPI)网络分析,Cytohubba插件筛选hub基因,通过Enrichr网站使用药物特征数据库预测靶向药物分子。结果:选择数据集GSE65198中的样本20例,分为2组。第1组20 mg·kg-1 Cr (Ⅵ) 1次暴露后1 d肝脏样本和对照样本各5例;第2组20 mg·kg-1 Cr (Ⅵ)1次暴露后7 d肝脏样本和对照样本各5例,以每组的对照样本作为阴性对照分别筛选得到342个和61个DEGs (|Log2 FC|>1和P<0.05)。GO富集分析,DEGs主要富集于对药品反应、有丝细胞分裂和衰老等生物学过程;KEGG分析,主要信号通路包括核糖体生物发生、细胞周...
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