| 广西、云南、河南三省旋毛虫系统发生关系研究 |
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| 引用本文： | 刘莹,欧阳颐,黎学铭,杨益超,苏爱荣,张陆娟.广西、云南、河南三省旋毛虫系统发生关系研究[J].中国热带医学,2009,9(5):796-798. |
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| 作者姓名： | 刘莹 欧阳颐 黎学铭 杨益超 苏爱荣 张陆娟 |
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| 作者单位： | 1. 广西医科大学寄生虫学教研室,广西,南宁,530021
2. 广西壮族自治区疾病预防控制中心,广西,南宁,530028 |
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| 摘 要： | 目的分析广西、云南和河南三地旋毛虫核糖体大亚基（mt—lsr RNA）基因差异，确定三个分离株的系统发生关系。方法分别提取三地旋毛虫分离株基因组，特异性扩增mt—lsr RNA基因。对三地旋毛虫及Genbank已知的旋毛虫相应基因序列进行对比研究。构建系统发生树，分析4株旋毛虫系统发生树的拓扑结构，同时收集三地的地理气候等信息，分析三地旋毛虫系统发生关系。结果广西旋毛虫分离株和云南旋毛虫分离株、河南分离株的mt—lsrRNA基因高度相似，在407个碱基对中，三地旋毛虫分离株与Genbank中T．spiralis序列相比，基因序列相似度很高，三个分离株在同一个位点发生T—C变异，此外，河南旋毛虫分离株在376位发生1个T—A变异。构建的系统发生树显示，广西分离株与云南、河南分离株及Genbank中的T．spiralis在同一分枝，进化距离为0．0000，自引导值为100，高度同源。三地旋毛虫与其它种类旋毛虫分于不同分枝，相距较远。结论三地旋毛虫分离株均为同一虫种，即T．spirilas，虽然宿主、地理环境及气候等因素不同，但进化差异小，亲缘关系近。
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| 关 键 词： | 旋毛虫 mt—lsr RNA 系统发生树 |
Study on phylogenetic relationships among Trichinella isolates from the three Provinces of Guangxi,Yunnan and Henan |
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| Institution: | LIU Ying, OU Yang-yi, LI Xue-ming,et al.( 1. Department of Parasitology, Guangxi Medical Univesity, Nanning 530021 ; 2.Guangxi Zhuang Autonomous Region Center for Disease Control and Prevention, Nanning 530028, Guangxi, P. R. China) |
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| Abstract: | Objective To analyze the genetic variation of large subunit ribosomal-RNA among Trichinella isolates from the three provinces of Guangxi,Yunnan,Henan and explore phylogenetic relationships. Methods Genome DNA of the three Trichinella isolates were extracted respectively and mt-lsr RNA gene were amplified as the DNA marker by PCR. The homological nucleotides of T.spiralis published were downloaded. All sequences were compared with each other and distance matrixes were estimated. According to the data,phyloge... |
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| Keywords: | Trichinella spiralis mt-lsr RNA Phylogenetic tree |
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