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建立16S rRNA基因聚合酶链反应方法快速检测脑膜炎奈瑟菌
引用本文:牛桓彩,田国忠.建立16S rRNA基因聚合酶链反应方法快速检测脑膜炎奈瑟菌[J].中国病原生物学杂志,2011(4).
作者姓名:牛桓彩  田国忠
作者单位:北京市昌平区疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
摘    要:目的建立以16S rRNA基因为靶基因的聚合酶链反应(PCR)方法,用于快速检测脑膜炎奈瑟菌。方法根据GenBank公布的奈瑟菌属16S rRNA基因序列,使用DNAstar软件设计引物,应用PCR方法特异检测脑膜炎奈瑟菌,对部分菌株结合16S rRNA基因测序和APIRNH生化鉴定系统以验证该方法的准确性,同时与文献报道的检测脑膜炎奈瑟菌crgA-PCR方法进行比较。结果 16S rRNA-PCR与crgA-PCR方法检测脑膜炎奈瑟菌阳性预测值皆为100%,阴性预测值分别为100%和46.94%,假阳性率分别为0%和36.73%,假阴性率皆为0%。约登指数分别为1和0.47。对188名健康儿童咽拭子杂菌DNA应用16S rRNA-PCR和crgA-PCR方法检测脑膜炎奈瑟菌,检测阳性率分别为18.62%(35/188)和15.96%(30/188)。两者同时检测到脑膜炎奈瑟菌的标本为7.98%(15/188)。结论 16SrRNA-PCR方法特异、敏感、快速,可用于脑膜炎奈瑟菌的快速检测与鉴定。

关 键 词:16S  rRNA基因  脑膜炎奈瑟菌  聚合酶链反应  

Rapid identification of Nesseria Meningitidis by PCR 16S rRNA gene polymerase chain reaction
NIU Huan-cai,TIAN Guo-zhong.Rapid identification of Nesseria Meningitidis by PCR 16S rRNA gene polymerase chain reaction[J].Journal of Pathogen Biology,2011(4).
Authors:NIU Huan-cai  TIAN Guo-zhong
Institution:NIU Huan-cai1,TIAN Guo-zhong2 (1.Center for Diseases Control and Prevention of Changping District,Changping,102200,Beijing,China,2.National Institute for Communicable Diseases Control and Prevention,Chinese Center for Diseases Control and Prevention)
Abstract:Objective To evaluate the efficiency of 16S rRNA gene polymerase chain reaction(16S rRNA PCR) to detect Nesseria Meningitidis(N.meningitidis) in various clinical/non-clinical samples. Methods The primers-specific were designed to amplify 16S rRNA genes of N.meningitides by PCR assay according to the analysis of conserved and variable regions in bacterial 16S rRNA genes Nesseria.And compared it to crgA-PCR assay for identification of N.meningitides from the literature. Results The positive predictive value o...
Keywords:16S rRNA gene  Nesseria meningitides  polymerase chain reaction  
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