生物信息学分析CysC特异性肽段及质谱验证 |
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引用本文: | 沈蕾,王惠民,季伙燕,沈培,王建新.生物信息学分析CysC特异性肽段及质谱验证[J].临床检验杂志,2017(6):444-447. |
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作者姓名: | 沈蕾 王惠民 季伙燕 沈培 王建新 |
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作者单位: | 南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001 |
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摘 要: | 目的用生物信息学技术分析半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(Cys C)的特异性肽段及其性质,并用质谱技术验证预测结果。方法用在线软件工具分析胰蛋白酶水解Cys C产生的肽段和同源性,预测特异性肽段质谱扫描离子化碎片信息;对人工合成的特异性多肽样品进行母离子扫描和子离子扫描,人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解后分析质谱,比较分析结果与预测结果。结果选择T3(ALDFAVGEYNK)肽段作为Cys C的特异性肽段,用串联质谱对T3样品M+2H]~(2+)进行子离子扫描,几乎可发现Skyline软件预测的所有b离子和y离子。人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解出的肽段与T3*在同一时间出峰。结论用生物信息学技术快速准确地筛选出了Cys C特异性肽段并准确预测该肽段质谱扫描离子化碎片。
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关 键 词: | 半胱氨酸蛋白酶抑制剂C 生物信息学技术 特异性肽段 质谱 |
收稿时间: | 2017/1/18 0:00:00 |
CysC specific peptides: bioinformatics analysis and mass spectrometry verification |
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