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生物信息学分析CysC特异性肽段及质谱验证
引用本文:沈蕾,王惠民,季伙燕,沈培,王建新.生物信息学分析CysC特异性肽段及质谱验证[J].临床检验杂志,2017(6):444-447.
作者姓名:沈蕾  王惠民  季伙燕  沈培  王建新
作者单位:南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001,南通大学附属医院检验科,江苏南通 226001
摘    要:目的用生物信息学技术分析半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(Cys C)的特异性肽段及其性质,并用质谱技术验证预测结果。方法用在线软件工具分析胰蛋白酶水解Cys C产生的肽段和同源性,预测特异性肽段质谱扫描离子化碎片信息;对人工合成的特异性多肽样品进行母离子扫描和子离子扫描,人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解后分析质谱,比较分析结果与预测结果。结果选择T3(ALDFAVGEYNK)肽段作为Cys C的特异性肽段,用串联质谱对T3样品M+2H]~(2+)进行子离子扫描,几乎可发现Skyline软件预测的所有b离子和y离子。人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解出的肽段与T3*在同一时间出峰。结论用生物信息学技术快速准确地筛选出了Cys C特异性肽段并准确预测该肽段质谱扫描离子化碎片。

关 键 词:半胱氨酸蛋白酶抑制剂C  生物信息学技术  特异性肽段  质谱
收稿时间:2017/1/18 0:00:00

CysC specific peptides: bioinformatics analysis and mass spectrometry verification
Abstract:
Keywords:
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