灰毡毛忍冬MYB转录因子家族成员的挖掘及鉴定 |
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引用本文: | 曾娟,龙雨青,付学森,王玲,刘紫璇,周日宝,刘湘丹.灰毡毛忍冬MYB转录因子家族成员的挖掘及鉴定[J].中国中药杂志,2023(8):2103-2115. |
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作者姓名: | 曾娟 龙雨青 付学森 王玲 刘紫璇 周日宝 刘湘丹 |
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作者单位: | 1. 湖南中医药大学药学院;2. 湘产大宗道地药材种质资源及规范化种植重点研究室;3. 湖南省普通高等学校中药现代化研究重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81673546,81203007);;湖南省自然科学基金项目(2021JJ30515,2021JJ30497);;财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系项目(CARS-21);;湖南中医药大学研究生科研创新项目(2022CX79,2021CX80); |
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摘 要: | MYB转录因子作为最大的转录因子家族之一,在调控花发育过程中起到重要作用。该文首次从灰毡毛忍冬转录组数据中鉴定出3条1R-MYB,47条R2R3-MYB,2条3R-MYB和1条4R-MYB转录因子,对其理化性质、保守结构域、家族进化关系及蛋白结构、功能信息及表达进行分析。结果表明,不同品种灰毡毛忍冬中53个MYB转录因子家族成员基因在保守基序、蛋白理化性质及结构、功能等各有不同,表明其在进化中具有保守性和多样性。表达分析表明LmMYB在品种间(野生型、湘蕾型)及器官间(花、叶)均存在转录水平上的显著差异,且部分基因特殊表达。在53条LmMYB中有43条在花、叶中均有表达,其中9个LmMYB成员在2个品种灰毡毛忍冬中在转录水平上存在显著差异,且在野生品种中上调表达。结合家族进化分析和表达分析推测LmMYB蛋白主要在生长发育、逆境胁迫、类黄酮次生代谢等方面发挥重要转录因子调控功能。该研究结果为后续研究灰毡毛忍冬MYB转录因子家族具体功能机制提供了理论基础和参考依据。
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关 键 词: | 灰毡毛忍冬 MYB 生物信息学 转录因子 |
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