基于重建分析的ceRNA网络在痛风中的调节机制北大核心CSCD

目的:探索有关痛风发病的ceRNA网络调控机制,寻找治疗痛风的潜在靶点。方法:计算机检索GEO数据库,下载lncRNA微阵列芯片GSE160170,分析系列矩阵文件得到差异lncRNA与mRNA。比对高度保守的miRNA家族文件后得出lncRNA-miRNA关联,预测miRNA调控的mRNA,与芯片数据差异分析得到的差异mRNA取交集,得出miRNA-mRNA关联。构建ceRNA网络,运用String数据库分析蛋白互作关系,筛选关键蛋白互作模块。R软件分析关键蛋白模块的功能与相关通路,挖掘关键模块ceRNA网络。结果:痛风疾病组与正常组比较共获得差异表达的354个lncRNAs(140个下调,214个上调)、693个mRNAs(399个下调,294个上调)。在差异表达lncRNA的ceRNA网络中,有86个lncRNAs(35个下调,51个上调)、29个miRNAs、57个mRNAs。GO富集分析涉及的生物过程DNA编码转录、调控细胞增殖凋亡、调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录等。KEGG涉及的信号通路有IL-17信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路等。挖掘关键模块获得9种lncRNAs、11种miRNAs、9种mRNAs。结论:ceRNA网络可能在痛风的发病过程中发挥关键作用,其中TTTY10/hsa-miR-139-5p/AP-1轴可能具有一定研究意义。