PLAU与MMP1在头颈鳞状细胞癌中的表达及临床预后意义 |
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引用本文: | 马俊杰,安韶光,陆进,张浩轩.PLAU与MMP1在头颈鳞状细胞癌中的表达及临床预后意义[J].赣南医学院学报,2023(1):17-26. |
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作者姓名: | 马俊杰 安韶光 陆进 张浩轩 |
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作者单位: | 1. 蚌埠医学院;2. 蚌埠医学院人体解剖学教研室;3. 数字医学与智慧健康安徽省重点实验室 |
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基金项目: | 安徽省高等学校自然科学研究重点项目(KJ2020A0553);;2021年教育部产学合作协同育人项目(202101160001); |
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摘 要: | 目的:基于生物信息学方法分析头颈鳞状细胞癌(Head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)关键基因PLAU与MMP1及其临床预后意义。方法:首先,通过基因表达总库(Gene Expression Omnibus,GEO)的GEO2R筛选4组HNSCC基因芯片数据的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),并利用Metascape数据库对DEGs进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Gene and Genome,KEGG)通路富集分析;其次,采用String数据库和Cytoscape软件CytoHubba插件的MCC算法进行蛋白互作网络(Protein-protein interaction,PPI)分析和HUB基因筛选;再次,利用GEPIA数据库分析前10个HUB基因表达量与HNSCC患者预后和临床分期关系;最后,利用TIMER、GEPIA和TISIDB数据库分析关键基因与免疫细胞浸润水平的关系以及临床生信...
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关 键 词: | 头颈鳞状细胞癌 PLAU MMP1 免疫细胞浸润 B细胞 |
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