铜死亡相关性lncRNA在甲状腺癌中的表达模式以及预后价值 |
| |
引用本文: | 农琛,刘德文,赖凤明,唐玉莲,王太重.铜死亡相关性lncRNA在甲状腺癌中的表达模式以及预后价值[J].右江民族医学院学报,2023(3):384-395. |
| |
作者姓名: | 农琛 刘德文 赖凤明 唐玉莲 王太重 |
| |
作者单位: | 1. 右江民族医学院研究生学院;2. 右江民族医学院基础医学院 |
| |
基金项目: | 广西自然科学基金项目(2019JJB140028); |
| |
摘 要: | 目的 探索与铜死亡相关的lncRNA在甲状腺癌(thyroid carcinoma, THCA)中的表达模式及预后价值。方法 基于TCGA数据集,通过共表达获得相关的lncRNA。将THCA患者随机分成训练集和验证集,基于Cox和LASSO回归分析确定预后关键基因,采用验证集和整个列队对独立预后基因进行验证,同时通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)验证关键基因在THCA中的表达情况。最后对风险模型进行富集分析、肿瘤微环境分析、免疫相关性分析以及药物敏感性分析。结果 12个铜死亡基因通过共表达获得1 270个相关的lncRNA。在16个与铜死亡预后相关的基因中,TMEM220-AS1、LINC01711和AC003086.1被确定为关键基因。风险评分在训练集和整个列队中均展示出良好的预测性能,并且qPCR结果与生信结果一致。高低风险组的患者在生物学功能、免疫细胞浸润程度以及免疫检查点均存在明显的不同。此外,风险评分与THCA的药物敏感性显著相关。结论 本研究证明了铜死亡相关性lncRNA在THCA中存在显著差异表达,并且3个关键的lncRNA在预测THCA的预后和生存方面具有一定价...
|
关 键 词: | 甲状腺肿瘤 铜死亡 lncRNA 预后标志物 免疫检查点 |
|