| 武汉地区戊型肝炎病毒开放读码框3的基因序列分析 |
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| 引用本文： | 朱永豹,黄元成,田德英. 武汉地区戊型肝炎病毒开放读码框3的基因序列分析[J]. 中华肝脏病杂志, 2012, 20(10): 766-768 |
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| 作者姓名： | 朱永豹 黄元成 田德英 |
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| 作者单位： | 华中科技大学同济医学院附属同济医院感染科,武汉,430030 |
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| 摘 要： | 目的 对武汉地区戊型肝炎病毒(HEV)开放读码框(ORF)3基因序列进行分析,并确定病毒基因型. 方法 收集103份抗-HEV IgM阳性血清,采用逆转录-巢式聚合酶链反应扩增HEV RNA两个基因片段(5020 ～ 5392nt和5347 ～ 5956 nt,EF570133)；对PCR产物进行测序,并用ContigExpress将测序结果拼接(含有ORF3基因),对ORF3基因序列进行分析.结果 103份抗-HEV IgM阳性血清中HEV RNA两个基因片段均扩增出来的样本为18份,18株HEV ORF3基因全长均为345 bp,编码114个氨基酸.各毒株间的核苷酸同源性为92.5％ ～ 99.4％,与基因Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型HEV的核苷酸同源性分别为83.5％ ～ 86.7％、83.2％ ～ 85.2％、84.6％ ～ 87.2％、92.0％ ～ 96.5％;系统进化分析表明该18株HEV均为基因Ⅳ型. 结论 武汉地区HEV主要为基因Ⅳ型,ORF3基因序列可用于同源进化分析.
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| 关 键 词： | 肝炎病毒,戊型 开放读码框3 核苷酸同源性 系统进化分析 |
Analysis of genotype IV distribution of hepatitis E virus infections in Wuhan by sequencing the open reading frame 3 gene |
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| ZHU Yong-bao , HUANG Yuan-cheng , TIAN De-ying. Analysis of genotype IV distribution of hepatitis E virus infections in Wuhan by sequencing the open reading frame 3 gene[J]. Chinese journal of hepatology, 2012, 20(10): 766-768 |
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| Authors: | ZHU Yong-bao HUANG Yuan-cheng TIAN De-ying |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hepatitis E virus Open reading frame 3 Sequence homology,nucleotide Phylogenetic analysis |
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